RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488157.5

NISCH-210, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 590 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-210ENST00000488157 GOLGA6DP0CG33 693 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 GIMD1P0DJR0 217 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 DGKAP23743 735 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 THOP1P52888 689 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 YPEL5P62699 121 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 MTM1Q13496 603 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 C1orf61Q13536 156 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 SPARCL1Q14515 664 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 SLC14A2Q15849 920 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 ENPP7Q6UWV6 458 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 EID2Q8N6I1 236 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 FAM174AQ8TBP5 190 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 RHBDD1Q8TEB9 315 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 FICDQ9BVA6 458 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 ZNF711Q9Y462 761 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 JRKLQ9Y4A0 524 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP12.11□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 SCN8AQ9UQD0 1980 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 TRIM38O00635 465 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 FFAR2O15552 330 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 FLRT2O43155 660 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 BUD23O43709 281 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 USP12O75317 370 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 FUCA1P04066 466 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 MYF5P13349 255 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 NME1P15531 152 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 ZNF30P17039 623 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 JUNDP17535 347 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 NFKBIAP25963 317 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 ADRA1AP35348 466 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 TRIM23P36406 574 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 KCNJ1P48048 391 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 SPINT3P49223 89 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 GEMP55040 296 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 CCDC173Q0VFZ6 552 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 MPP3Q13368 585 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 PTPRCAPQ14761 206 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 NFATC4Q14934 902 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 SLC1A5Q15758 541 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 LONRF2Q1L5Z9 754 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 ALG11Q2TAA5 492 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 MACC1Q6ZN28 852 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 MICALCLQ6ZW33 695 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 RD3Q7Z3Z2 195 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 TMC3Q7Z5M5 1100 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 TRIM74Q86UV6 250 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 PARGQ86W56 976 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 HEATR4Q86WZ0 1026 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 OXR1Q8N573 874 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 GPR26Q8NDV2 337 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 COG1Q8WTW3 980 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 OR1E3Q8WZA6 343 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 AP2M1Q96CW1 435 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 MAGEE1Q9HCI5 957 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 BPIFA1Q9NP55 256 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 ZNF148Q9UQR1 794 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 MYLKQ15746 1914 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 FADS2P1A8MWK0 482 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 ZNF185O15231 689 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 INPP4BO15327 924 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 GCATO75600 419 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 ANXA9O76027 345 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 STK10O94804 968 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 EPOP01588 193 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 CEACAM1P13688 526 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 POLD2P49005 469 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 PTK2BQ14289 1009 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 ALS2CLQ60I27 953 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 RAET1GQ6H3X3 334 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 DENND5AQ6IQ26 1287 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 CCDC70Q6NSX1 233 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 RANBP10Q6VN20 620 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 HID1Q8IV36 788 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 PHACTR4Q8IZ21 702 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 TTC30BQ8N4P2 665 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 PRELID2Q8N945 189 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 PDXPQ96GD0 296 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 FERMT1Q9BQL6 677 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-210ENST00000488157 TEX101Q9BY14 249 aa12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms