RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485792.1

CUX1-208, Transcript of cut like homeobox 1, human

TSL 5

Gene CUX1, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CUX1-208	ENST00000485792	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	GAREM1	Q9H706	876 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	NOD2	Q9HC29	1040 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	SPTB	P11277	2137 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	ATM	Q13315	3056 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	MGA	Q8IWI9	3026 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	ITPR1	Q14643	2758 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	CHD6	Q8TD26	2715 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	CCDC66	A2RUB6	948 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	IGLON5	A6NGN9	336 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	PSMD11	O00231	422 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	DFFA	O00273	331 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	YKT6	O15498	198 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	GPR39	O43194	453 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	OPHN1	O60890	802 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	PGLS	O95336	258 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	CER1	O95813	267 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	FUCA1	P04066	466 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	CFI	P05156	583 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	MYF5	P13349	255 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	CCNB1	P14635	433 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	MX2	P20592	715 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	TEAD1	P28347	426 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	SERPINA4	P29622	427 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	MMP13	P45452	471 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	SERPINB4	P48594	390 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	GSDMD	P57764	484 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	YPEL5	P62699	121 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	DSC2	Q02487	901 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	ELP6	Q0PNE2	266 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	WASHC5	Q12768	1159 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	XRCC4	Q13426	336 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	SPA17	Q15506	151 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	LIPI	Q6XZB0	460 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	BBS12	Q6ZW61	710 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	DPPA4	Q7L190	304 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	TTC7B	Q86TV6	843 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	SLC25A45	Q8N413	288 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	OR13H1	Q8NG92	308 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	SERAC1	Q96JX3	654 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	TBATA	Q96M53	351 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	COQ10A	Q96MF6	247 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	CALN1	Q9BXU9	219 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	SP110	Q9HB58	689 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792		A0A0J9YYE9	177 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	LRRD1	A4D1F6	860 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792	USP27X	A6NNY8	438 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CUX1-208	ENST00000485792		F5H423	210 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49

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