RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482056.2

C9orf3-218, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf3, Length 1,951 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-218ENST00000482056 MID1IP1Q9NPA3 183 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 KCTD3Q9Y597 815 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 DRGXA6NNA5 263 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 F8W810 466 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 NR5A2O00482 541 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 CSPG5O95196 566 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 MT-CO1P00395 513 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 GFAPP14136 432 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 ARSAP15289 507 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 MAGEA11P43364 429 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 KCNC1P48547 511 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 BNIP2Q12982 314 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 UGT3A2Q3SY77 523 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 SPATS1Q496A3 300 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 C6orf10Q5SRN2 563 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 KRT80Q6KB66 452 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 FBXL22Q6P050 247 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 BORAQ6PGQ7 559 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 PGBD5Q8N414 524 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 OR9I1Q8NGQ6 314 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 OR4L1Q8NH43 312 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 BRSK1Q8TDC3 778 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 TWIST2Q8WVJ9 160 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 MPP4Q96JB8 637 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 ARMC1Q9NVT9 282 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 TTC3P53804 2025 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 VILLO15195 856 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 CRCPO75575 148 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 CDK14O94921 469 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 LBPP18428 481 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 OR1E1P30953 314 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 CDH13P55290 713 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 SH3BP2P78314 561 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 GK3PQ14409 553 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 TMEM259Q4ZIN3 620 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 MTX3Q5HYI7 312 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 KANK2Q63ZY3 851 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 KLHDC10Q6PID8 442 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 DDIASQ8IXT1 998 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 ANKFN1Q8N957 763 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 GOLM1Q8NBJ4 401 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 IGSF8Q969P0 613 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 FBXO32Q969P5 355 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 SLCO4A1Q96BD0 722 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 ZNF599Q96NL3 588 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 CCDC68Q9H2F9 335 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 ETAA1Q9NY74 926 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 MARCH2Q9P0N8 246 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 NOD1Q9Y239 953 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 CCDC162PA2VCL2 907 aa15.33■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 AQP12BA6NM10 295 aa15.33■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 ZNF839A8K0R7 811 aa15.33■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa15.33■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 PIP5K1BO14986 540 aa15.33■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 AKAP10O43572 662 aa15.33■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 PRAMEF11O60813 436 aa15.33■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 SERPINF2P08697 491 aa15.33■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 CYBAP13498 195 aa15.33■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 ATP6V0D1P61421 351 aa15.33■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 FOXM1Q08050 763 aa15.33■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 PFKFB4Q16877 469 aa15.33■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 COQ5Q5HYK3 327 aa15.33■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 C10orf120Q5SQS8 335 aa15.33■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 ZNF549Q6P9A3 640 aa15.33■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 CYHR1Q6ZMK1 362 aa15.33■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa15.33■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 FUNDC1Q8IVP5 155 aa15.33■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 AQP12AQ8IXF9 295 aa15.33■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 METTL25Q8N6Q8 603 aa15.33■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 PACRGLQ8N7B6 248 aa15.33■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 TSPAN14Q8NG11 270 aa15.33■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 STAG3L4Q8TBR4 150 aa15.33■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 HIC2Q96JB3 615 aa15.33■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 C3orf30Q96M34 536 aa15.33■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 CYP2S1Q96SQ9 504 aa15.33■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 TCF12Q99081 682 aa15.33■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 TMEM79Q9BSE2 394 aa15.33■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 PFDN4Q9NQP4 134 aa15.33■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 PNPLA3Q9NST1 481 aa15.33■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 PCDHGB4Q9UN71 923 aa15.33■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa15.33■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 ARL5AQ9Y689 179 aa15.33■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 ANKRD36A6QL64 1941 aa15.33■□□□□ 0.04
C9orf3-218ENST00000482056 SYCE1LA8MT33 242 aa15.33■□□□□ 0.04
C9orf3-218ENST00000482056 UBXN8O00124 270 aa15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.2 ms