RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477941.2

PDE4DIP-212, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4DIP, Length 586 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIP-212ENST00000477941 CCNB1P14635 433 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 CTPS1P17812 591 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 NFKBIAP25963 317 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 AK4P27144 223 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 SERPINB6P35237 376 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 POLD2P49005 469 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 CDH6P55285 790 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 CDK3Q00526 305 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP13.07□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 KRT81Q14533 505 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 NR1I3Q14994 352 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 AMZ1Q400G9 498 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 MAP9Q49MG5 647 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 ARMC12Q5T9G4 340 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 HGSNATQ68CP4 663 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 RAET1GQ6H3X3 334 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 SLC30A9Q6PML9 568 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 USP45Q70EL2 814 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 TSPAN33Q86UF1 283 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 NRROSQ86YC3 692 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 GPBAR1Q8TDU6 330 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 SCRN2Q96FV2 425 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 CMKLR1Q99788 373 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 GSDMCQ9BYG8 508 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 THAP2Q9H0W7 228 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 SEMA6CQ9H3T2 930 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 KCTD5Q9NXV2 234 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 TAAR2Q9P1P5 351 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 ANAPC7Q9UJX3 599 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 SUFUQ9UMX1 484 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 BSNQ9UPA5 3926 aa13.06□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa13.06□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 RHPN2P1A8MT19 583 aa13.06□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 PSMD11O00231 422 aa13.06□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 NVLO15381 856 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 B4GAT1O43505 415 aa13.06□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 PRAMEF10O60809 474 aa13.06□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 CPNE6O95741 557 aa13.06□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 FGF1P05230 155 aa13.06□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 KRT10P13645 584 aa13.06□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 ALDH4A1P30038 563 aa13.06□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 ETV5P41161 510 aa13.06□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 SSR1P43307 286 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 MAPK10P53779 464 aa13.06□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 OR1D5P58170 312 aa13.06□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 B4GALNT1Q00973 533 aa13.06□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 MMRN1Q13201 1228 aa13.06□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 IQCB1Q15051 598 aa13.06□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 RALGPS1Q5JS13 557 aa13.06□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 DOK6Q6PKX4 331 aa13.06□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 RFLNAQ6ZTI6 216 aa13.06□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 USP53Q70EK8 1073 aa13.06□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 SLITRK4Q8IW52 837 aa13.06□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP13.06□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 NIPA2Q8N8Q9 360 aa13.06□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 TEKT4Q8WW24 435 aa13.06□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 PATE1Q8WXA2 126 aa13.06□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 TMEM159Q96B96 161 aa13.06□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 MED8Q96G25 268 aa13.06□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 SMIM14Q96QK8 99 aa13.06□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 NUP85Q9BW27 656 aa13.06□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 NT5MQ9NPB1 228 aa13.06□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 FOXJ2Q9P0K8 574 aa13.06□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 IP6K2Q9UHH9 426 aa13.06□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 CD84Q9UIB8 345 aa13.06□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 ACSL6Q9UKU0 697 aa13.06□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 ST14Q9Y5Y6 855 aa13.06□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 MYO18BQ8IUG5 2567 aa13.05□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 ECEL1O95672 775 aa13.05□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 PDHA1P08559 390 aa13.05□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 CD48P09326 243 aa13.05□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 LIPCP11150 499 aa13.05□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 IL4RP24394 825 aa13.05□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 GPR1P46091 355 aa13.05□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 CTBSQ01459 385 aa13.05□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 ITKQ08881 620 aa13.05□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 BIRC2Q13490 618 aa13.05□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 C16orf72Q14CZ0 275 aa13.05□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 FIGNQ5HY92 759 aa13.05□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 LRRC66Q68CR7 880 aa13.05□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 PIM3Q86V86 326 aa13.05□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 ZFAND4Q86XD8 727 aa13.05□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 PIH1D2Q8WWB5 315 aa13.05□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 USP7Q93009 1102 aa13.05□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 SEMA3CQ99985 751 aa13.05□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 NUDT22Q9BRQ3 303 aa13.05□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa13.05□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PDE4DIP-212ENST00000477941 A0A087X0T9 212 aa13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms