RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467246.5

HPS1-208, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, human

TSL 1 (best)

Gene HPS1, Length 2,791 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HPS1-208	ENST00000467246	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	TTC1	Q99614	292 aa		11.43	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		11.43	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		11.43	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		11.43	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		11.43	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	COL4A6	Q14031	1691 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246		H3BMM5	538 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	SUPT7L	O94864	414 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	ANPEP	P15144	967 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	IMPDH1	P20839	514 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	SLC26A3	P40879	764 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	NUDT2	P50583	147 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	C1QTNF8	P60827	252 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	MUM1	Q2TAK8	710 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	ZNF333	Q96JL9	665 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	FAM50B	Q9Y247	325 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	TBL1X	O60907	577 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	TMCC1	O94876	653 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	FMO4	P31512	558 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	DEFB103A	P81534	67 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	VEPH1	Q14D04	833 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	OR4D1	Q15615	310 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	PHC3	Q8NDX5	983 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	TOP1MT	Q969P6	601 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	ZNF558	Q96NG5	402 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	POMP	Q9Y244	141 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	MED16	Q9Y2X0	877 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246		H0Y626	953 aa		11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	SUOX	P51687	545 aa		11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	CDH13	P55290	713 aa		11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	TRAF2	Q12933	501 aa		11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	RAB33A	Q14088	237 aa		11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	CCNI	Q14094	377 aa		11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	ZNF678	Q5SXM1	525 aa		11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	TXNDC8	Q6A555	127 aa		11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	CLEC6A	Q6EIG7	209 aa		11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	EFHB	Q8N7U6	833 aa		11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	HIPK4	Q8NE63	616 aa		11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	RCN3	Q96D15	328 aa		11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	C2orf81	A6NN90	581 aa		11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	PPP6C	O00743	305 aa		11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	BAG2	O95816	211 aa		11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	AP2B1	P63010	937 aa		11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	UNC50	Q53HI1	259 aa		11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	ANO7	Q6IWH7	933 aa		11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	UCMA	Q8WVF2	138 aa		11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	STON2	Q8WXE9	905 aa		11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	LPGAT1	Q92604	370 aa		11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	SH3GL3	Q99963	347 aa		11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	GALP	Q9UBC7	116 aa		11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	TBX21	Q9UL17	535 aa		11.41	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	UBXN8	O00124	270 aa		11.4	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	GREM1	O60565	184 aa		11.4	□□□□□ -0.58
HPS1-208	ENST00000467246	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58

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