RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467065.1

UBXN4-205, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene UBXN4, Length 334 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-205ENST00000467065 RAB7BQ96AH8 199 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 FEM1CQ96JP0 617 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 SPATA13Q96N96 652 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 NUDCD1Q96RS6 583 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 FAM118BQ9BPY3 351 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 CARD6Q9BX69 1037 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 SUV39H2Q9H5I1 410 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 GLOD4Q9HC38 313 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 PCDH9Q9HC56 1237 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 FZD3Q9NPG1 666 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 FAM114A2Q9NRY5 505 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 TOR4AQ9NXH8 423 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 BFARQ9NZS9 450 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 PCYOX1Q9UHG3 505 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 PHTF1Q9UMS5 762 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 PKP3Q9Y446 797 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 MRFAP1Q9Y605 127 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 WASF2Q9Y6W5 498 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 RP1P56715 2156 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 KNTC1P50748 2209 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 APC2O95996 2303 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 A0A1B0GTQ1 180 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 A0A1W2PQU0 124 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 TLR4O00206 839 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 LAMA5O15230 3695 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 SLC31A1O15431 190 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 ST8SIA5O15466 376 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 PCDHGA12O60330 932 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 SDC3O75056 442 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 SOCS5O75159 536 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 PMPCBO75439 489 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 LEFTY1O75610 366 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 PCDH8O95206 1070 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 TRIM16O95361 564 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 CD160O95971 181 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 S1PR4O95977 384 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 EPOP01588 193 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 UGT2B4P06133 528 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 PTPN3P26045 913 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 GKP32189 559 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 CD86P42081 329 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 GRK6P43250 576 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 KCNJ1P48048 391 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 NPY2RP49146 381 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 VPS41P49754 854 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 TERF1P54274 439 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 NXPH1P58417 271 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 RPL26P61254 145 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 CDK18Q07002 472 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 CYTH1Q15438 398 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 SHBQ15464 509 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 KIF26BQ2KJY2 2108 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 INAVAQ3KP66 663 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 MAP9Q49MG5 647 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 ZNF805Q5CZA5 627 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 FAM208BQ5VWN6 2430 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 SEL1L3Q68CR1 1132 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 DBX2Q6ZNG2 339 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 NLRP9Q7RTR0 991 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 MARCH9Q86YJ5 346 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 PALM2Q8IXS6 379 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 PPIL6Q8IXY8 311 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 ZNF567Q8N184 647 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 TEX26Q8N6G2 289 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 NPWQ8N729 165 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 PRELID2Q8N945 189 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 NETO2Q8NC67 525 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 NBEAQ8NFP9 2946 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 IPMKQ8NFU5 416 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 SLC35B2Q8TB61 432 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 CCDC110Q8TBZ0 833 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 CXorf40AQ8TE69 158 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 SNF8Q96H20 258 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 EXOC2Q96KP1 924 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 OLFM3Q96PB7 478 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 FCRL5Q96RD9 977 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 IL12RB2Q99665 862 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 CDC6Q99741 560 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 GPR63Q9BZJ6 419 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 FAM129AQ9BZQ8 928 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 TRIM31Q9BZY9 425 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms