RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466624.1

GPC1-207, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 2

Gene GPC1, Length 782 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-207ENST00000466624 RIMKLBQ9ULI2 386 aa15.98■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 COQ6Q9Y2Z9 468 aa15.98■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 PI4KAP42356 2102 aa15.98■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 A0A0U1RQS6 177 aa15.97■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 HEATR9A2RTY3 570 aa15.97■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa15.97■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 AURKAO14965 403 aa15.97■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 SLC31A1O15431 190 aa15.97■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 LDB2O43679 373 aa15.97■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 PYGLP06737 847 aa15.97■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 GNSP15586 552 aa15.97■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 LPOP22079 712 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 ADRA1DP25100 572 aa15.97■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 PSMA3P25788 255 aa15.97■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 TEAD1P28347 426 aa15.97■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 ETV3P41162 512 aa15.97■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 MAGEA3P43357 314 aa15.97■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 RPL21P46778 160 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 CALCOCO2Q13137 446 aa15.97■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 DENND2CQ68D51 928 aa15.97■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 Q6ZVL8 140 aa15.97■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 IQCHQ86VS3 1027 aa15.97■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 KLK6Q92876 244 aa15.97■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 PEX13Q92968 403 aa15.97■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 SERAC1Q96JX3 654 aa15.97■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa15.97■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 TRIM31Q9BZY9 425 aa15.97■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 SNX24Q9Y343 169 aa15.97■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 PKP3Q9Y446 797 aa15.97■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa15.97■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 SDK1Q7Z5N4 2213 aa15.96■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 A0A1B0GTW7 788 aa15.96■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 MROH6A6NGR9 719 aa15.96■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 FPGTO14772 594 aa15.96■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 TP73O15350 636 aa15.96■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 LMNAP02545 664 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 RETP07949 1114 aa15.96■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 TPH1P17752 444 aa15.96■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 MAOBP27338 520 aa15.96■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 ITGA8P53708 1063 aa15.96■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 TERF1P54274 439 aa15.96■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 CAV1Q03135 178 aa15.96■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 OVGP1Q12889 678 aa15.96■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 CBLBQ13191 982 aa15.96■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 MTM1Q13496 603 aa15.96■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 POU6F1Q14863 301 aa15.96■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 WSCD2Q2TBF2 565 aa15.96■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 PCID2Q5JVF3 399 aa15.96■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 CERCAMQ5T4B2 595 aa15.96■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 NLRP9Q7RTR0 991 aa15.96■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa15.96■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 CEP76Q8TAP6 659 aa15.96■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 ABCG8Q9H221 673 aa15.96■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 TM9SF3Q9HD45 589 aa15.96■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 FAM86C1Q9NVL1 165 aa15.96■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 GRHL1Q9NZI5 618 aa15.96■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 ANAPC5Q9UJX4 755 aa15.96■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 ARL5AQ9Y689 179 aa15.96■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 CACNA1EQ15878 2313 aa15.96■□□□□ 0.15
GPC1-207ENST00000466624 RAD51BO15315 384 aa15.95■□□□□ 0.14
GPC1-207ENST00000466624 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
GPC1-207ENST00000466624 STX7O15400 261 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
GPC1-207ENST00000466624 TSHRP16473 764 aa15.95■□□□□ 0.14
GPC1-207ENST00000466624 BPIP17213 487 aa15.95■□□□□ 0.14
GPC1-207ENST00000466624 IGFALSP35858 605 aa15.95■□□□□ 0.14
GPC1-207ENST00000466624 HADHAP40939 763 aa15.95■□□□□ 0.14
GPC1-207ENST00000466624 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
GPC1-207ENST00000466624 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
GPC1-207ENST00000466624 STAT4Q14765 748 aa15.95■□□□□ 0.14
GPC1-207ENST00000466624 IRF4Q15306 451 aa15.95■□□□□ 0.14
GPC1-207ENST00000466624 LPAL2Q16609 132 aa15.95■□□□□ 0.14
GPC1-207ENST00000466624 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
GPC1-207ENST00000466624 PDPK2PQ6A1A2 396 aa15.95■□□□□ 0.14
GPC1-207ENST00000466624 GCNT7Q6ZNI0 430 aa15.95■□□□□ 0.14
GPC1-207ENST00000466624 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
GPC1-207ENST00000466624 MFSD2AQ8NA29 543 aa15.95■□□□□ 0.14
GPC1-207ENST00000466624 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
GPC1-207ENST00000466624 STYXQ8WUJ0 223 aa15.95■□□□□ 0.14
GPC1-207ENST00000466624 PIGKQ92643 395 aa15.95■□□□□ 0.14
GPC1-207ENST00000466624 AP2M1Q96CW1 435 aa15.95■□□□□ 0.14
GPC1-207ENST00000466624 SLC6A18Q96N87 628 aa15.95■□□□□ 0.14
GPC1-207ENST00000466624 FAM129AQ9BZQ8 928 aa15.95■□□□□ 0.14
GPC1-207ENST00000466624 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa15.95■□□□□ 0.14
GPC1-207ENST00000466624 DPH5Q9H2P9 285 aa15.95■□□□□ 0.14
GPC1-207ENST00000466624 FAM83DQ9H4H8 585 aa15.95■□□□□ 0.14
GPC1-207ENST00000466624 FZD3Q9NPG1 666 aa15.95■□□□□ 0.14
GPC1-207ENST00000466624 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
GPC1-207ENST00000466624 TMEM74BQ9NUR3 256 aa15.95■□□□□ 0.14
GPC1-207ENST00000466624 GMEB2Q9UKD1 530 aa15.95■□□□□ 0.14
GPC1-207ENST00000466624 TCAF1Q9Y4C2 921 aa15.95■□□□□ 0.14
GPC1-207ENST00000466624 A0A1W2PR77 199 aa15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms