RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466245.1

TTLL3-223, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 3

Gene TTLL3, Length 616 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-223	ENST00000466245	MYOC	Q99972	504 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	RP1	P56715	2156 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	HACD1	B0YJ81	288 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245		K7ESM1	405 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	PSMD11	O00231	422 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	KRT86	O43790	486 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	FZD6	O60353	706 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	PPFIA2	O75334	1257 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	TM7SF2	O76062	418 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	TNFSF15	O95150	251 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	APOC2	P02655	101 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	KRT10	P13645	584 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	PRLR	P16471	622 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	CA4	P22748	312 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	CETN2	P41208	172 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	RABIF	P47224	123 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	SCNN1B	P51168	640 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	SKOR1	P84550	965 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	SGCG	Q13326	291 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	XRCC4	Q13426	336 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	SPIDR	Q14159	915 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	FGL2	Q14314	439 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	COLEC12	Q5KU26	742 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	CFAP58	Q5T655	872 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	DPPA4	Q7L190	304 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	CLEC14A	Q86T13	490 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	CENPT	Q96BT3	561 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	SCRN2	Q96FV2	425 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	TBATA	Q96M53	351 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	VAT1	Q99536	393 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	STRADB	Q9C0K7	418 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	NOD2	Q9HC29	1040 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	SSUH2	Q9Y2M2	353 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	NEMP1	O14524	444 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	FPGT	O14772	594 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	NRDC	O43847	1150 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	CST8	O60676	142 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	PGLS	O95336	258 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	PIGN	O95427	931 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	MARCKSL1	P49006	195 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	RWDD2B	P57060	319 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	PFN3	P60673	137 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	RALGDS	Q12967	914 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	CLN3	Q13286	438 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	CDKN3	Q16667	212 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	NLRP8	Q86W28	1048 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	PARG	Q86W56	976 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	JAML	Q86YT9	394 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	NETO2	Q8NC67	525 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	TADA1	Q96BN2	335 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	BMF	Q96LC9	184 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	LYSMD1	Q96S90	227 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	SEMA3C	Q99985	751 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	NT5M	Q9NPB1	228 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	STARD5	Q9NSY2	213 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	TFR2	Q9UP52	801 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	LRRK2	Q5S007	2527 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	IGLON5	A6NGN9	336 aa		10.07	□□□□□ -0.8

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