RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC7A5Q01650 507 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 CCDC15Q0P6D6 951 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 SEMA5AQ13591 1074 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC1A5Q15758 541 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF528Q3MIS6 628 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 ANKRD22Q5VYY1 191 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 IZUMO3Q5VZ72 239 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 DENND2CQ68D51 928 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 DENND5AQ6IQ26 1287 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 CCDC70Q6NSX1 233 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 ERAP2Q6P179 960 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 RANBP10Q6VN20 620 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 MAATS1Q7Z4T9 603 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 TSPAN33Q86UF1 283 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 PRSS33Q8NF86 280 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 OR52K1Q8NGK4 314 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 CPT1BQ92523 772 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 NELL1Q92832 810 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 KLK6Q92876 244 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 RAB7BQ96AH8 199 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM131CQ96AQ9 280 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 LRRC45Q96CN5 670 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 HSH2DQ96JZ2 352 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 LRRC1Q9BTT6 524 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 GPR174Q9BXC1 333 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 ADGRE3Q9BY15 652 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 DPH5Q9H2P9 285 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 LRRC40Q9H9A6 602 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 L2HGDHQ9H9P8 463 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 SGK2Q9HBY8 427 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 ZSCAN32Q9NX65 697 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 B4GALT6Q9UBX8 382 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 FZD4Q9ULV1 537 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 SNX24Q9Y343 169 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 PLXNA2O75051 1894 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 SCN8AQ9UQD0 1980 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 VCANP13611 3396 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A0J9YYE9 177 aa8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 CAPN8A6NHC0 703 aa8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 LRRC72A6NJI9 287 aa8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 EFCAB8A8MWE9 144 aa8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 ANKRD66B4E2M5 251 aa8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 GOLGA8MH3BSY2 632 aa8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 AREL1O15033 823 aa8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 RPP40O75818 363 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 FSBPO95073 299 aa8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 EPOP01588 193 aa8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 TRBC1P01850 177 aa8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 EPXP11678 715 aa8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 LHCGRP22888 699 aa8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 IVDP26440 423 aa8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 VIPR1P32241 457 aa8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 MMP12P39900 470 aa8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 RPL21P46778 160 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 GRIA4P48058 902 aa8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 RPL26P61254 145 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 PPP2CBP62714 309 aa8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 PPP2CAP67775 309 aa8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 ELP6Q0PNE2 266 aa8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 TCF15Q12870 199 aa8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 RALGDSQ12967 914 aa8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 KCNJ11Q14654 390 aa8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM52BQ4KMG9 183 aa8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 SEL1L3Q68CR1 1132 aa8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 C8orf74Q6P047 294 aa8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 CRTC1Q6UUV9 634 aa8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 USP45Q70EL2 814 aa8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 DPPA4Q7L190 304 aa8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEFF1Q8IYR6 380 aa8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 NDUFAF2Q8N183 169 aa8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM151AQ8N4L1 468 aa8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 OR2T34Q8NGX1 318 aa8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 CCHCR1Q8TD31 782 aa8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 CXorf40AQ8TE69 158 aa8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 GAB3Q8WWW8 586 aa8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 SCRN2Q96FV2 425 aa8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 SPACA7Q96KW9 195 aa8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.5 ms