RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462357.1

IMP4-209, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 5

Gene IMP4, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-209ENST00000462357 CEP104O60308 925 aa20.55■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 CLDN7O95471 211 aa20.55■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 LHCGRP22888 699 aa20.55■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 DGKAP23743 735 aa20.55■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 CD68P34810 354 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 STC1P52823 247 aa20.55■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 KIAA1024LP59773 190 aa20.55■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 PEX6Q13608 980 aa20.55■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 GALNT3Q14435 633 aa20.55■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 ELOCQ15369 112 aa20.55■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa20.55■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 GLRX5Q86SX6 157 aa20.55■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 TSPAN33Q86UF1 283 aa20.55■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 FAM71DQ8N9W8 422 aa20.55■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 IPMKQ8NFU5 416 aa20.55■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 TRIB3Q96RU7 358 aa20.55■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 FAM83DQ9H4H8 585 aa20.55■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 OR1A2Q9Y585 309 aa20.55■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 GOLGA8CPA6NN73 597 aa20.54■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 GCATO75600 419 aa20.54■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 PIAS2O75928 621 aa20.54■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 FGF1P05230 155 aa20.54■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 BNIP3Q12983 259 aa20.54■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 CCNG2Q16589 344 aa20.54■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 LONRF2Q1L5Z9 754 aa20.54■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 ZNF569Q5MCW4 686 aa20.54■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 C4orf22Q6V702 233 aa20.54■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 GATAD2AQ86YP4 633 aa20.54■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 CCDC89Q8N998 374 aa20.54■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 OR56A4Q8NGH8 313 aa20.54■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 SLC35B2Q8TB61 432 aa20.54■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 FAM118BQ9BPY3 351 aa20.54■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 HERPUD2Q9BSE4 406 aa20.54■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 USP29Q9HBJ7 922 aa20.54■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 SCAMP1O15126 338 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 PPFIA2O75334 1257 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 GAS8O95995 478 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 FGGP02679 453 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 SPINT3P49223 89 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 SRP54P61011 504 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 PDE1BQ01064 536 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 SHBQ15464 509 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 SLC1A5Q15758 541 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 PHACTR4Q8IZ21 702 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 EID2Q8N6I1 236 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 CCDC110Q8TBZ0 833 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 TLR10Q9BXR5 811 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 NLGN3Q9NZ94 848 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 LAMA1P25391 3075 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 PLXNA2O75051 1894 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 TPP1O14773 563 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 AQP9O43315 295 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 LIASO43766 372 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 CBFA2T3O75081 653 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 ANXA6P08133 673 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 C1SP09871 688 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 RPIAP49247 311 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 HK3P52790 923 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 IHHQ14623 411 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 ZNF542PQ5EBM4 170 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 KDELC1Q6UW63 502 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 TMC3Q7Z5M5 1100 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 GKN2Q86XP6 184 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 HID1Q8IV36 788 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 PLA2G15Q8NCC3 412 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 LMX1AQ8TE12 382 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 MRGPRX2Q96LB1 330 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 CAMK1GQ96NX5 476 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 TMEM121Q9BTD3 319 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 TEX101Q9BY14 249 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 ABCG8Q9H221 673 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 C10orf88Q9H8K7 445 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 MOSPD1Q9UJG1 213 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 PKP3Q9Y446 797 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 ZNF711Q9Y462 761 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 DGKBQ9Y6T7 804 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 DMXL1Q9Y485 3027 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-209ENST00000462357 C2orf81A6NN90 581 aa20.51■□□□□ 0.87
IMP4-209ENST00000462357 SDC3O75056 442 aa20.51■□□□□ 0.87
IMP4-209ENST00000462357 LMAN1P49257 510 aa20.51■□□□□ 0.87
IMP4-209ENST00000462357 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
IMP4-209ENST00000462357 PRRT3Q5FWE3 981 aa20.51■□□□□ 0.87
IMP4-209ENST00000462357 SIRPB2Q5JXA9 342 aa20.51■□□□□ 0.87
IMP4-209ENST00000462357 PDPK2PQ6A1A2 396 aa20.51■□□□□ 0.87
IMP4-209ENST00000462357 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
IMP4-209ENST00000462357 LVRNQ6Q4G3 990 aa20.51■□□□□ 0.87
IMP4-209ENST00000462357 GSTA5Q7RTV2 222 aa20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms