RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460308.6

ABCD4-202, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ABCD4, Length 1,003 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-202ENST00000460308 TRIM23P36406 574 aa21.39■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 GPR1P46091 355 aa21.39■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 BLKP51451 505 aa21.39■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 RAET1GQ6H3X3 334 aa21.39■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 KDELC1Q6UW63 502 aa21.39■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa21.39■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 NRSN1Q8IZ57 195 aa21.39■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 SLC35B2Q8TB61 432 aa21.39■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 MAIP1Q8WWC4 291 aa21.39■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 LRRC45Q96CN5 670 aa21.39■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 MRGPRX2Q96LB1 330 aa21.39■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 WDR92Q96MX6 357 aa21.39■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 GPR63Q9BZJ6 419 aa21.39■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 SLC13A1Q9BZW2 595 aa21.39■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 FTSJ1Q9UET6 329 aa21.39■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 SHOC2Q9UQ13 582 aa21.39■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 JRKLQ9Y4A0 524 aa21.39■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa21.38■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 C5orf60A6NFR6 353 aa21.38■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 CEP104O60308 925 aa21.38■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 PIRTP0C851 137 aa21.38■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 PSMB4P28070 264 aa21.38■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 STIP1P31948 543 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 KIAA1024LP59773 190 aa21.38■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 DPTQ07507 201 aa21.38■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF569Q5MCW4 686 aa21.38■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 RFLNAQ6ZTI6 216 aa21.38■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF765Q7L2R6 523 aa21.38■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 RD3Q7Z3Z2 195 aa21.38■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 HID1Q8IV36 788 aa21.38■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 PHACTR4Q8IZ21 702 aa21.38■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 SLC25A41Q8N5S1 370 aa21.38■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 ATG4AQ8WYN0 398 aa21.38■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 TMEM121Q9BTD3 319 aa21.38■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 ABCG8Q9H221 673 aa21.38■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 SPASTQ9UBP0 616 aa21.38■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 KLQ9UEF7 1012 aa21.38■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 KLF15Q9UIH9 416 aa21.38■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 DCHS1Q96JQ0 3298 aa21.38■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 K7ESM1 405 aa21.37■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 ENC1O14682 589 aa21.37■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 KIF5CO60282 957 aa21.37■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 SLC4A1P02730 911 aa21.37■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 PYGLP06737 847 aa21.37■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 ALPPL2P10696 532 aa21.37■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 CTSEP14091 401 aa21.37■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 HLA-DPA1P20036 260 aa21.37■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 CXCR5P32302 372 aa21.37■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 FOXK2Q01167 660 aa21.37■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 CCDC173Q0VFZ6 552 aa21.37■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 CDKN3Q16667 212 aa21.37■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa21.37■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa21.37■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 NLRP8Q86W28 1048 aa21.37■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 SLC25A45Q8N413 288 aa21.37■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 LMX1AQ8TE12 382 aa21.37■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 C1orf54Q8WWF1 131 aa21.37■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 SCAMP4Q969E2 229 aa21.37■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 UCKL1Q9NWZ5 548 aa21.37■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 MOSPD1Q9UJG1 213 aa21.37■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF148Q9UQR1 794 aa21.37■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF711Q9Y462 761 aa21.37■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 RGSL1A5PLK6 1076 aa21.36■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 FFAR2O15552 330 aa21.36■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 TNFSF14O43557 240 aa21.36■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 LIASO43766 372 aa21.36■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 GCATO75600 419 aa21.36■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 RASGRP1O95267 797 aa21.36■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 TNFP01375 233 aa21.36■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 FGGP02679 453 aa21.36■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 TEAD1P28347 426 aa21.36■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 ACTN2P35609 894 aa21.36■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 SPINT3P49223 89 aa21.36■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 SRP54P61011 504 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 SNX1Q13596 522 aa21.36■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 SLC1A5Q15758 541 aa21.36■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 LONRF2Q1L5Z9 754 aa21.36■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 PARP6Q2NL67 630 aa21.36■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 PRRT3Q5FWE3 981 aa21.36■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 SIRPB2Q5JXA9 342 aa21.36■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 HEATR4Q86WZ0 1026 aa21.36■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 PELI3Q8N2H9 469 aa21.36■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 OR56A4Q8NGH8 313 aa21.36■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 FICDQ9BVA6 458 aa21.36■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 FAM83DQ9H4H8 585 aa21.36■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 RAD18Q9NS91 495 aa21.36■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 DNAH14Q0VDD8 3507 aa21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms