RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441703.5

HDAC6-210, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC6, Length 599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-210ENST00000441703 PHTF1Q9UMS5 762 aa6.53□□□□□ -1.36
HDAC6-210ENST00000441703 DMTF1Q9Y222 760 aa6.53□□□□□ -1.36
HDAC6-210ENST00000441703 SNX24Q9Y343 169 aa6.53□□□□□ -1.36
HDAC6-210ENST00000441703 SH3GLB1Q9Y371 365 aa6.53□□□□□ -1.36
HDAC6-210ENST00000441703 PCNX1Q96RV3 2341 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 SLC12A8A0AV02 714 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 PRR19A6NJB7 356 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 EFCAB7A8K855 629 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 SCAMP1O15126 338 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 MUSKO15146 869 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 MDM4O15151 490 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 GSC2O15499 205 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 AP1G1O43747 822 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 STC2O76061 302 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 CLDN1O95832 211 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 FGGP02679 453 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 HMBSP08397 361 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 DLDP09622 509 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 TMEM253P0C7T8 217 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 GIMD1P0DJR0 217 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 BRAFP15056 766 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 EPHB2P29323 1055 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 CRABP2P29373 138 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 FOXN2P32314 431 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 RPL21P46778 160 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 PSMD8P48556 350 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 PGFP49763 221 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 RAP1GDS1P52306 607 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 ADPRHP54922 357 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 PPP2CBP62714 309 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 PPP2CAP67775 309 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 HPCAP84074 193 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 CAV1Q03135 178 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 CBX3Q13185 183 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 RAPGEF1Q13905 1077 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 FGL2Q14314 439 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 KRT72Q14CN4 511 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 RCN1Q15293 331 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 SURF1Q15526 300 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 DUOXA2Q1HG44 320 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 ZCWPW2Q504Y3 356 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 C10orf120Q5SQS8 335 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 FAM91A1Q658Y4 838 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 DYMQ7RTS9 669 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 ZFAND4Q86XD8 727 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 SFR1Q86XK3 245 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 RELL1Q8IUW5 271 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 TRIM59Q8IWR1 403 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 SLC34A3Q8N130 599 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 AHI1Q8N157 1196 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 ARHGAP24Q8N264 748 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 OR5B17Q8NGF7 314 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 DENND1AQ8TEH3 1009 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 C10orf82Q8WW14 230 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 RAD54LQ92698 747 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 SLCO2A1Q92959 643 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 NAT6Q93015 286 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 SLC35B4Q969S0 331 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 HAUS1Q96CS2 278 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 ERP27Q96DN0 273 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 CALML4Q96GE6 196 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 ABHD17AQ96GS6 310 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 NSL1Q96IY1 281 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 ACCSQ96QU6 501 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 CBWD1Q9BRT8 395 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 BTBD10Q9BSF8 475 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 SLC12A9Q9BXP2 914 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 CALN1Q9BXU9 219 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 GPAMQ9HCL2 828 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 KCNK9Q9NPC2 374 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 KRT82Q9NSB4 513 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 CLEC4EQ9ULY5 219 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 U3KQA8 63 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 CSMD1Q96PZ7 3565 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 CENPEQ02224 2701 aa6.51□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa6.51□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 A0A0J9YVX5 310 aa6.51□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 GOLGA8IPA6NC78 632 aa6.51□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 GOLGA8JA6NMD2 632 aa6.51□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 TTLL8A6PVC2 850 aa6.51□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 H3BM21 787 aa6.51□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.372e-9■■■■■ 34.3
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