RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436881.2

C9orf172-201, Transcript of Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene C9orf172, Length 4,387 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172-201ENST00000436881 PSMG2Q969U7 264 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 TCF12Q99081 682 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 GORASP1Q9BQQ3 440 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 ZFP14Q9HCL3 533 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 IRS2Q9Y4H2 1338 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 RABGGTBP53611 331 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 TAS2R39P59534 338 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 RPL38P63173 70 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP16.06■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 SLC9A4Q6AI14 798 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 ADHFE1Q8IWW8 467 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 OR6K2Q8NGY2 324 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 TADA1Q96BN2 335 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 SUSD3Q96L08 255 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 SYT11Q9BT88 431 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 CFAP97Q9P2B7 532 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 LINC00032P0C843 101 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 ACAP2Q15057 778 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 NRF1Q16656 503 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 LPCAT2Q7L5N7 544 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF276Q8N554 614 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 QRFPRQ96P65 431 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 HERPUD2Q9BSE4 406 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 KLHL28Q9NXS3 571 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 SNX8Q9Y5X2 465 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 SH3BGRLO75368 114 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 LINGO3P0C6S8 592 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 IVDP26440 423 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 SLC7A2P52569 658 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF132P52740 706 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 TJAP1Q5JTD0 557 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 LPCAT4Q643R3 524 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 DET1Q7L5Y6 550 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 WDR60Q8WVS4 1066 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 RAD21L1Q9H4I0 556 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 ATAD3AQ9NVI7 634 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 GAD2Q05329 585 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 KCNJ11Q14654 390 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 FAM182AQ5T1J6 154 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 ENOPH1Q9UHY7 261 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 NR2E3Q9Y5X4 410 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 KCNE2Q9Y6J6 123 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 TK2O00142 265 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 HS6ST1O60243 411 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 DEFA1P59665 94 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 DEFA3P59666 94 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 DOK6Q6PKX4 331 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 BRSK1Q8TDC3 778 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 TIFAQ96CG3 184 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 MAGED4Q96JG8 741 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 MYH1P12882 1939 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 MYH4Q9Y623 1939 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 ANKDD1BA6NHY2 528 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 BBIP1A8MTZ0 92 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 SGTAO43765 313 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 GPR1P46091 355 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 APLP1P51693 650 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 MOGSQ13724 837 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 CNSTQ6PJW8 725 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 GALNT15Q8N3T1 639 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 C16orf70Q9BSU1 422 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 TLR6Q9Y2C9 796 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 A0A1W2PQ67 120 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 INSIG1O15503 277 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 NEK2P51955 445 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 CACUL1Q86Y37 369 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 FBXO30Q8TB52 745 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 NPY6RQ99463 290 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 AGAP2Q99490 1192 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 APOL4Q9BPW4 351 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 CEP44Q9C0F1 390 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 TEX264Q9Y6I9 313 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 UBR2Q8IWV8 1755 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 CACNA1SQ13698 1873 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 WDR47O94967 919 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 GRIA1P42261 906 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 PRMT2P55345 433 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 PURAQ00577 322 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 TNK2Q07912 1038 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 PDK3Q15120 406 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 TTC23Q5W5X9 447 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 GPR180Q86V85 440 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 DENND6AQ8IWF6 608 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 CXorf40AQ8TE69 158 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 DCAKDQ8WVC6 231 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf172-201ENST00000436881 GPR21Q99679 349 aa16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms