RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 HHATQ5VTY9 493 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF470Q6ECI4 717 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 FAM45BPQ6NSW5 357 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 CRTC1Q6UUV9 634 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 SNX20Q7Z614 316 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 UNC5BQ8IZJ1 945 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 DCLK2Q8N568 766 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 FAM45AQ8TCE6 357 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 DYDC1Q8WWB3 177 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 ULK4Q96C45 1275 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 APOPT1Q96IL0 206 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 FAM129BQ96TA1 746 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 HDAC8Q9BY41 377 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 CCDC68Q9H2F9 335 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 KCNK12Q9HB15 430 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 SYTL2Q9HCH5 934 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 PKD2L2Q9NZM6 624 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 ACOT9Q9Y305 439 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 PLLPQ9Y342 182 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 SPO11Q9Y5K1 396 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 HMX2A2RU54 273 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 GMNCA6NCL1 334 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 AGAP14A8MT82 685 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 BNIP3LO60238 219 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 HAUS5O94927 633 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 ADH1BP00325 375 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 ESR1P03372 595 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 PYGLP06737 847 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 ITGALP20701 1170 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 KCNA5P22460 613 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 NTSR1P30989 418 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 SPAM1P38567 509 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 SLC1A2P43004 574 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 ATP1A2P50993 1020 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 STC1P52823 247 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 DCDC1P59894 354 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 RAB10P61026 200 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 GNGT1P63211 74 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 PTSQ03393 145 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 ZBTB16Q05516 673 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 CTBP1Q13363 440 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 ITIH4Q14624 930 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 USP10Q14694 798 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 TERF2Q15554 542 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 AAK1Q2M2I8 961 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 FBXL19Q6PCT2 694 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 RGS9BPQ6ZS82 235 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 DPPA4Q7L190 304 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 OTUD6BQ8N6M0 293 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 CHST14Q8NCH0 376 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 OR13C4Q8NGS5 318 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 TTC8Q8TAM2 541 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF398Q8TD17 642 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 TCP10LQ8TDR4 215 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 CKAP2Q8WWK9 683 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 SORCS1Q8WY21 1168 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 VOPP1Q96AW1 172 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 GRAMD1AQ96CP6 724 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 SERAC1Q96JX3 654 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 MAGEB18Q96M61 343 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 EPN3Q9H201 632 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 KLHL42Q9P2K6 505 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 LIMD1Q9UGP4 676 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 CDH22Q9UJ99 828 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 KCTD3Q9Y597 815 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 PSAT1Q9Y617 370 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 STON1Q9Y6Q2 735 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 BRWD1Q9NSI6 2320 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-211ENST00000425989 MYLKQ15746 1914 aa9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 C2CD4DB7Z1M9 353 aa9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 H3BQ06 376 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 K7EQS6 105 aa9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 QSOX1O00391 747 aa9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 AURKAO14965 403 aa9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 AP1G1O43747 822 aa9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 UGT1A9O60656 530 aa9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 SRP72O76094 671 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 CLDN7O95471 211 aa9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 ASMTLO95671 621 aa9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms