RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
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CCL20-202ENST00000409189 SLMAPQ14BN4 828 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 OASLQ15646 514 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 SMTNL2Q2TAL5 461 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 CCDC14Q49A88 953 aa6.7□□□□□ -1.34
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CCL20-202ENST00000409189 FAM171BQ6P995 826 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ZDHHC24Q6UX98 284 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 LRIG3Q6UXM1 1119 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 BEND5Q7L4P6 421 aa6.7□□□□□ -1.34
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CCL20-202ENST00000409189 CROCCP2Q86T23 111 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 KBTBD6Q86V97 674 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 COLGALT2Q8IYK4 626 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 THEM5Q8N1Q8 247 aa6.7□□□□□ -1.34
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CCL20-202ENST00000409189 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ATL2Q8NHH9 583 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 SLC35B2Q8TB61 432 aa6.7□□□□□ -1.34
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CCL20-202ENST00000409189 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.343e-15■■■■■ 32.4
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CCL20-202ENST00000409189 TMEM175Q9BSA9 504 aa6.7□□□□□ -1.34
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CCL20-202ENST00000409189 MENTQ9BUN1 341 aa6.7□□□□□ -1.34
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CCL20-202ENST00000409189 DPH5Q9H2P9 285 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa6.7□□□□□ -1.34
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CCL20-202ENST00000409189 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 TBC1D13Q9NVG8 400 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 MIOSQ9NXC5 875 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 GRHL1Q9NZI5 618 aa6.7□□□□□ -1.34
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CCL20-202ENST00000409189 RAI2Q9Y5P3 530 aa6.7□□□□□ -1.34
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CCL20-202ENST00000409189 SCAPQ12770 1279 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 DPYSL3Q14195 570 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 NOMO1Q15155 1222 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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CCL20-202ENST00000409189 SLC25A52Q3SY17 297 aa6.69□□□□□ -1.34
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CCL20-202ENST00000409189 ZNF852Q6ZMS4 543 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 PAQR9Q6ZVX9 377 aa6.69□□□□□ -1.34
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CCL20-202ENST00000409189 OR10T2Q8NGX3 314 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 C1orf54Q8WWF1 131 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 HSPH1Q92598 858 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ART4Q93070 314 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 NT5C3BQ969T7 300 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 NTAN1Q96AB6 310 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 FAM149B1Q96BN6 582 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 CFAP57Q96MR6 1250 aa6.69□□□□□ -1.34
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