RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407997.3

APOBEC3G-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3G, Length 1,834 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-201ENST00000407997 BAG2O95816 211 aa10.01□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 SMIM18P0DKX4 95 aa10.01□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 OR1E1P30953 314 aa10.01□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 CNR2P34972 360 aa10.01□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 GRIA2P42262 883 aa10.01□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 CXCL12P48061 93 aa10.01□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 INHBCP55103 352 aa10.01□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 GPX6P59796 221 aa10.01□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 WASHC5Q12768 1159 aa10.01□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 MPP3Q13368 585 aa10.01□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 FZD5Q13467 585 aa10.01□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 MARC1Q5VT66 337 aa10.01□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 FBXL22Q6P050 247 aa10.01□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 TMC8Q8IU68 726 aa10.01□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa10.01□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 AHI1Q8N157 1196 aa10.01□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF687Q8N1G0 1237 aa10.01□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 SYNPOQ8N3V7 929 aa10.01□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 TTC9BQ8N6N2 239 aa10.01□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 TRPC4APQ8TEL6 797 aa10.01□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 RMDN1Q96DB5 314 aa10.01□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 IL12RB2Q99665 862 aa10.01□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 FAM118BQ9BPY3 351 aa10.01□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 CCDC106Q9BWC9 280 aa10.01□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 LRRC3Q9BY71 257 aa10.01□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 ATXN3LQ9H3M9 355 aa10.01□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 TASP1Q9H6P5 420 aa10.01□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF696Q9H7X3 374 aa10.01□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 SP110Q9HB58 689 aa10.01□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 E2F8A0AVK6 867 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 FAM72CH0Y354 149 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 DFFAO00273 331 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 SNPHO15079 494 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 MSI1O43347 362 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 ATP6V1G1O75348 118 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 ENO1P06733 434 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 GJA1P17302 382 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 PTPN3P26045 913 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 CCNFP41002 786 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 HSPA13P48723 471 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 SCNN1BP51168 640 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 GDF10P55107 478 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 CDH17Q12864 832 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 MMEL1Q495T6 779 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 MPPE1Q53F39 396 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 FAM72AQ5TYM5 149 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 PIK3R6Q5UE93 754 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 FAM72DQ6L9T8 149 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 RAPH1Q70E73 1250 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 HTR3DQ70Z44 454 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 ARPINQ7Z6K5 226 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 FAM72BQ86X60 149 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 TREML1Q86YW5 311 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 SPEM1Q8N4L4 309 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 ICA1LQ8NDH6 482 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 LGMNQ99538 433 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 THTPAQ9BU02 230 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 IL22Q9GZX6 179 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 CCSER2Q9H7U1 834 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 DLL3Q9NYJ7 618 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 SLC17A7Q9P2U7 560 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 VANGL2Q9ULK5 521 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 RAB26Q9ULW5 256 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 SH3GLB1Q9Y371 365 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 ARNTLO00327 626 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 VILLO15195 856 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 LRP3O75074 770 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 STC2O76061 302 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 KLHL2O95198 593 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 TNFAIP8O95379 198 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 CLPTM1O96005 669 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 EPOP01588 193 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 POLBP06746 335 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 CHRNB1P11230 501 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 ETS2P15036 469 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 GABRR2P28476 465 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 CPOXP36551 454 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 MAPK8P45983 427 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 SERPINB9P50453 376 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 ADARP55265 1226 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 SPIDRQ14159 915 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 SFT2D3Q587I9 215 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 GPR158Q5T848 1215 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms