RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389993.7

PSME4-201, Transcript of proteasome activator subunit 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PSME4, Length 6,581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4-201ENST00000389993 MIOSQ9NXC5 875 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 MAGEA13PA6NCF6 341 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 IFNA16P05015 189 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 LPCAT4Q643R3 524 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 ATG7O95352 703 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 LPIN1Q14693 890 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 ANKRD46Q86W74 232 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 CPNE9Q8IYJ1 553 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 CITO14578 2027 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 GRM6O15303 877 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 FGF1P05230 155 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 PIK3R1P27986 724 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 GJA5P36382 358 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 SLC1A2P43004 574 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 SLC11A1P49279 550 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 TIGD2Q4W5G0 525 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 GPR88Q9GZN0 384 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 COPG2Q9UBF2 871 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 SRRDQ9UH36 339 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 CATP04040 527 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 PHKG1Q16816 387 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 FOXR2Q6PJQ5 311 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 GPR141Q7Z602 305 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 HPS6Q86YV9 775 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 MATN3O15232 486 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 NBNO60934 754 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 UNC5CO95185 931 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 CHRNGP07510 517 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 RHOQP17081 205 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 PPM1AP35813 382 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 DGCR6Q14129 220 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 TMEM40Q8WWA1 233 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 TRAF6Q9Y4K3 522 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 AZIN1O14977 448 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 INSIG1O15503 277 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 CNTN5O94779 1100 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 EPN2O95208 641 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 ZNF276Q8N554 614 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 OR8D1Q8WZ84 308 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 COQ4Q9Y3A0 265 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 ITGB4P16144 1822 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 FAM72CH0Y354 149 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 PSME3P61289 254 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 NAB1Q13506 487 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 FAM72AQ5TYM5 149 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 FAM72DQ6L9T8 149 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 FAM72BQ86X60 149 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 CAMK1DQ8IU85 385 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 GULP1Q9UBP9 304 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 CYTH4Q9UIA0 394 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 RASGRP1O95267 797 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 ADH1CP00326 375 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 VPS26BQ4G0F5 336 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 GPAT3Q53EU6 434 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 MPPE1Q53F39 396 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 PPP2R2DQ66LE6 453 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 SH3RF2Q8TEC5 729 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 USP7Q93009 1102 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 PPM1MQ96MI6 270 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 SMOQ99835 787 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 TCAF1Q9Y4C2 921 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 MYH15Q9Y2K3 1946 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 ALS2Q96Q42 1657 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 EDF1O60869 148 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.086e-7■■□□□ 12
PSME4-201ENST00000389993 HEXDCQ8WVB3 486 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 A0A0G2JN53 185 aa14.54□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 UMPSP11172 480 aa14.54□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 LSM3P62310 102 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 PARP15Q460N3 678 aa14.54□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 SERPINA9Q86WD7 417 aa14.54□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 RHOJQ9H4E5 214 aa14.54□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 FLRT1Q9NZU1 646 aa14.54□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 CNTN3Q9P232 1028 aa14.54□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 DEC1Q9P2X7 70 aa14.54□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 TIE1P35590 1138 aa14.54□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 HPCAL1P37235 193 aa14.54□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 PTPN9P43378 593 aa14.54□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 MAPKAPK3Q16644 382 aa14.54□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 RNF44Q7L0R7 432 aa14.54□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 CRTAC1Q9NQ79 661 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms