RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384105.1

RNU6V-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear variant sequence with SNRPE pseudogene sequence, humanhuman

BASIC

Gene RNU6V, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6V-201ENST00000384105 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP0.1□□□□□ -2.39
RNU6V-201ENST00000384105 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6V-201ENST00000384105 TEX13BQ9BXU2 312 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6V-201ENST00000384105 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
RNU6V-201ENST00000384105 FN3KRPQ9HA64 309 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6V-201ENST00000384105 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP0.1□□□□□ -2.39
RNU6V-201ENST00000384105 SIX2Q9NPC8 291 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6V-201ENST00000384105 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP0.1□□□□□ -2.39
RNU6V-201ENST00000384105 ANKRD10Q9NXR5 420 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6V-201ENST00000384105 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
RNU6V-201ENST00000384105 GRHL1Q9NZI5 618 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6V-201ENST00000384105 NUDT4Q9NZJ9 180 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6V-201ENST00000384105 FBXL17Q9UF56 701 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6V-201ENST00000384105 GLS2Q9UI32 602 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6V-201ENST00000384105 SLC25A13Q9UJS0 675 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6V-201ENST00000384105 TRHDEQ9UKU6 1024 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6V-201ENST00000384105 ZNF175Q9Y473 711 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6V-201ENST00000384105 MYO10Q9HD67 2058 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6V-201ENST00000384105 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 TBC1D3EA0A087X179 549 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 A0A0A0MQY5 61 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 A0A0G2JLM5 398 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 LOC100653049A0A140TA62 436 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 TBC1D3BA6NDS4 549 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 DUXAA6NLW8 204 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 TBC1D3LB9A6J9 549 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 SNAP23O00161 211 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 TAF4O00268 1085 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 ENPP3O14638 875 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 ZNHIT1O43257 154 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 IDH3BO43837 385 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 IGSF3O75054 1194 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 KRT34O76011 436 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 PDE9AO76083 593 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 UBXN7O94888 489 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 AP2A2O94973 939 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 NDUFB4O95168 129 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 C22orf31O95567 290 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 IL33O95760 270 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 HPP00738 406 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 MT-ND5P03915 603 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 TBC1D3HP0C7X1 549 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 IDEP14735 1019 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 CSF2RAP15509 400 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 EGR1P18146 543 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 BCL3P20749 454 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 RRM1P23921 792 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 CNGA1P29973 690 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 AHRP35869 848 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 PIGAP37287 484 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 RIPK4P57078 832 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 RPL15P61313 204 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 KRT83P78385 493 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 CAPSQ13938 189 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 PTPN21Q16825 1174 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 KRT24Q2M2I5 525 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 SLC5A9Q2M3M2 681 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 PLEKHG6Q3KR16 790 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 DCAF10Q5QP82 559 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 SDE2Q6IQ49 451 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 RGMBQ6NW40 437 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 FAM171BQ6P995 826 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 CRTC1Q6UUV9 634 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 IL27RAQ6UWB1 636 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 IGFL2Q6UWQ7 119 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 FRRS1Q6ZNA5 592 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 RNF44Q7L0R7 432 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 MAEAQ7L5Y9 396 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 CEACAM19Q7Z692 300 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 C5orf24Q7Z6I8 188 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 PLD3Q8IV08 490 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 CCDC28AQ8IWP9 274 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 LSMEM2Q8N112 164 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 ADSSL1Q8N142 457 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 OR4N2Q8NGD1 307 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 MIPOL1Q8TD10 442 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 DUSP19Q8WTR2 217 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 SSC4DQ8WTU2 575 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 BADQ92934 168 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 HSPBAP1Q96EW2 488 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 GIMAP5Q96F15 307 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 LINGO1Q96FE5 620 aa0.09□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms