RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379435.3

TRBV20OR9-2-201, Transcript of T cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional), humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene TRBV20OR9-2, Length 416 nt, Biotype TR V gene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 CBFA2T3O75081 653 aa12.88□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 PIAS2O75928 621 aa12.88□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 FGGP02679 453 aa12.88□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 CSF2P04141 144 aa12.88□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 NME1P15531 152 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 JUNDP17535 347 aa12.88□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 DGKAP23743 735 aa12.88□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 HTR1BP28222 390 aa12.88□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 GEMP55040 296 aa12.88□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP12.88□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 CCDC173Q0VFZ6 552 aa12.88□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 SNX1Q13596 522 aa12.88□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 INAVAQ3KP66 663 aa12.88□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 SIRPB2Q5JXA9 342 aa12.88□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 RAET1GQ6H3X3 334 aa12.88□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 ENPP7Q6UWV6 458 aa12.88□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa12.88□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 ERMP1Q7Z2K6 904 aa12.88□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa12.88□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 RD3Q7Z3Z2 195 aa12.88□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 SLC25A45Q8N413 288 aa12.88□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 CCHCR1Q8TD31 782 aa12.88□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 AP2M1Q96CW1 435 aa12.88□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 FICDQ9BVA6 458 aa12.88□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 LGR4Q9BXB1 951 aa12.88□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 WDR26Q9H7D7 661 aa12.88□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa12.88□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 KCTD5Q9NXV2 234 aa12.88□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 PYCARDQ9ULZ3 195 aa12.88□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 ZNF711Q9Y462 761 aa12.88□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 JRKLQ9Y4A0 524 aa12.88□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 SPO11Q9Y5K1 396 aa12.88□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 SCN8AQ9UQD0 1980 aa12.88□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 NCOR2Q9Y618 2525 aa12.88□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 TMEM202A6NGA9 273 aa12.87□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 H3BM21 787 aa12.87□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 AURKAO14965 403 aa12.87□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 SCAMP1O15126 338 aa12.87□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 FFAR2O15552 330 aa12.87□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 ANXA9O76027 345 aa12.87□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 TSHRP16473 764 aa12.87□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 TRIM23P36406 574 aa12.87□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 GPR1P46091 355 aa12.87□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 SPINT3P49223 89 aa12.87□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 PPARDQ03181 441 aa12.87□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 DPTQ07507 201 aa12.87□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 OLIG2Q13516 323 aa12.87□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 C1orf61Q13536 156 aa12.87□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 PRPSAP1Q14558 356 aa12.87□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 OASLQ15646 514 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 SLC1A5Q15758 541 aa12.87□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 LONRF2Q1L5Z9 754 aa12.87□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 FAXCQ5TGI0 409 aa12.87□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 HEATR4Q86WZ0 1026 aa12.87□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 HID1Q8IV36 788 aa12.87□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 PHACTR4Q8IZ21 702 aa12.87□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 NRSN1Q8IZ57 195 aa12.87□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 LMX1AQ8TE12 382 aa12.87□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 EID2BQ96D98 161 aa12.87□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 WDR92Q96MX6 357 aa12.87□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 AGAP2Q99490 1192 aa12.87□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 FSD1LQ9BXM9 530 aa12.87□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 GPR63Q9BZJ6 419 aa12.87□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 MAGEE1Q9HCI5 957 aa12.87□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 PKD2L2Q9NZM6 624 aa12.87□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 KLQ9UEF7 1012 aa12.87□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 ZNF148Q9UQR1 794 aa12.87□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 BPTFQ12830 3046 aa12.86□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 KIF5CO60282 957 aa12.86□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 GCATO75600 419 aa12.86□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 METTL18O95568 372 aa12.86□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 SOD1P00441 154 aa12.86□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 AGTP01019 485 aa12.86□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 EPOP01588 193 aa12.86□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 HLA-DPA1P20036 260 aa12.86□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 KIAA1024LP59773 190 aa12.86□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 SRP54P61011 504 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 CDK3Q00526 305 aa12.86□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 SPARCL1Q14515 664 aa12.86□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 TCEA2Q15560 299 aa12.86□□□□□ -0.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 PARP6Q2NL67 630 aa12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms