RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 AMZ1Q400G9 498 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 CDONQ4KMG0 1287 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACSM2BQ68CK6 577 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 SIGIRRQ6IA17 410 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHST9Q7L1S5 443 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 SZRD1Q7Z422 152 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADGRF2Q8IZF7 708 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPATA6LQ8N4H0 392 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR14L1PQ8NHC6 308 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZBTB9Q96C00 473 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 MTBPQ96DY7 904 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 ELMOD3Q96FG2 381 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 CAMK1GQ96NX5 476 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACOX2Q99424 681 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 SH3GL2Q99962 352 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 KXD1Q9BQD3 176 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC25A33Q9BSK2 321 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM204Q9BSN7 226 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDZD7Q9H5P4 517 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 KAT6BQ8WYB5 2073 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A0U1RQJ8 604 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 LACTBL1A8MY62 500 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 H3BQ06 376 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 NDUFS7O75251 213 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 TSPAN9O75954 239 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 GFPT2O94808 682 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 EGFP01133 1207 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 ALPLP05186 524 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 CLTBP09497 229 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM90A13PP0C7W8 464 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM90A24PP0C7X0 464 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 ITGB8P26012 769 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 HOXC9P31274 260 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 HOXD13P35453 343 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 GARSP41250 739 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 COMPP49747 757 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 CAMPP49913 170 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 CLCN3P51790 818 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 GALCP54803 685 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 SNX16P57768 344 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 NLRP5P59047 1200 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 CREB5Q02930 508 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHAF1BQ13112 559 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 CUL4AQ13619 759 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 WTAPQ15007 396 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 RILPL1Q5EBL4 403 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM69BQ5VUD6 431 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 CFAP161Q6P656 301 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDXDC1Q6P996 788 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 CLEC4GQ6UXB4 293 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC36A4Q6YBV0 504 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 TAOK1Q7L7X3 1001 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 ELP5Q8TE02 316 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMED6Q8WW62 240 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 WASF1Q92558 559 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGSF8Q969P0 613 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 MOAP1Q96BY2 351 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 PHF21BQ96EK2 531 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 PGAM5Q96HS1 289 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 GHITMQ9H3K2 345 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLK3Q9H4B4 646 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 NOX4Q9NPH5 578 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 OGFRQ9NZT2 677 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 WNT16Q9UBV4 365 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC9A2Q9UBY0 812 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 FBXW11Q9UKB1 542 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 C1orf226A1L170 272 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 CPED1A4D0V7 1026 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 AGAP14A8MT82 685 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 BTBD18B2RXH4 712 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 SOCS6O14544 535 aa2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms