RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 SSR2P43308 183 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 CHN2P52757 468 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 FAM129CQ86XR2 697 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 CD99L2Q8TCZ2 262 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 FAM155BO75949 473 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 SLC6A2P23975 617 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 MYDGFQ969H8 173 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 KLRG1Q96E93 195 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 HSD17B14Q9BPX1 270 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 BRINP2Q9C0B6 783 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 RASGRP1O95267 797 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 ANXA8L1Q5VT79 327 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 TGFB1I1O43294 461 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 SNX3O60493 162 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 KRT36O76013 467 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 ABHD2P08910 425 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 XYLT1Q86Y38 959 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 OR4K2Q8NGD2 314 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 RDH11Q8TC12 318 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF607Q96SK3 696 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 GLOD4Q9HC38 313 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 PLSCR1O15162 318 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 ALAS2P22557 587 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 RABGGTBP53611 331 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 FSTL1Q12841 308 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 ARSHQ5FYA8 562 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 E9PAM4 449 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM40Q6P9F5 258 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF398Q8TD17 642 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 OMA1Q96E52 524 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP22.36■■□□□ 1.172e-6■■■■■ 27.6
PTPRM-201ENST00000332175 SERPINB7O75635 380 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 ECDO95905 644 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 SULT2A1Q06520 285 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 ABHD15Q6UXT9 468 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 CHSY3Q70JA7 882 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 SLC17A7Q9P2U7 560 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 AGLP35573 1532 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 TFPIP10646 304 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 SELPP16109 830 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 BMP6P22004 513 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 AQP1P29972 269 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 SLC5A3P53794 718 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 RNF43Q68DV7 783 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 AADATQ8N5Z0 425 aa22.35■■□□□ 1.17
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PTPRM-201ENST00000332175 MFSD11O43934 449 aa22.35■■□□□ 1.17
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PTPRM-201ENST00000332175 CES1P23141 567 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 CLCNKBP51801 687 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 PTPN5P54829 565 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 RBBP4Q09028 425 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 BROXQ5VW32 411 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 ARCQ7LC44 396 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 KRT74Q7RTS7 529 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 OR7A2PQ8NGA2 310 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 BTN2A3PQ96KV6 586 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 PCDHB18PQ96TA0 734 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM138Q9NPI0 162 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 ERGIC3Q9Y282 383 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 BTNL10A8MVZ5 291 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 HDAC3O15379 428 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 CCNDBP1O95273 360 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 OR14C36Q8NHC7 312 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 RAI2Q9Y5P3 530 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 SLC22A3O75751 556 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 TNFRSF8P28908 595 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 SMIM11AP58511 58 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 PDK4Q16654 411 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 RFX4Q33E94 735 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 GK5Q6ZS86 529 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 UTS2BQ765I0 119 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 CUZD1Q86UP6 607 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 C17orf64Q86WR6 236 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 NEK7Q8TDX7 302 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 PDCD10Q9BUL8 212 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 SLC28A3Q9HAS3 691 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 DERAQ9Y315 318 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 BTBD19C9JJ37 291 aa22.34■■□□□ 1.17
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