RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 TMC3Q7Z5M5 1100 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 MFSD2AQ8NA29 543 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 BMFQ96LC9 184 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 TRIM51Q9BSJ1 452 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 FSCN3Q9NQT6 498 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 SEMA4GQ9NTN9 838 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 KCTD5Q9NXV2 234 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 SLC6A14Q9UN76 642 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 BPTFQ12830 3046 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 PCDH15Q96QU1 1955 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 A0A1B0GVT2 93 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 A0A1W2PR77 199 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 A6NNZ2 444 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 BUD23O43709 281 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 GFRA3O60609 400 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 WNT1P04628 370 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF806P0C7X5 589 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 TPSB2P20231 275 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 SPINT3P49223 89 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 C21orf59P57076 290 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 KCNJ11Q14654 390 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 TPSAB1Q15661 275 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 CPT1BQ92523 772 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 SKA1Q96BD8 255 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 AP2M1Q96CW1 435 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 KLHDC7BQ96G42 594 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 BPIFA1Q9NP55 256 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF292O60281 2723 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 ESPNB1AK53 854 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 LRP3O75074 770 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 HMGCLP35914 325 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 IRX4P78413 519 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 INPP5AQ14642 412 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 POU6F1Q14863 301 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 NRSN1Q8IZ57 195 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 TTC30BQ8N4P2 665 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 PLA2G15Q8NCC3 412 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 OR13H1Q8NG92 308 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 BRSK1Q8TDC3 778 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 SCAMP4Q969E2 229 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 ABCG8Q9H221 673 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 CAPN10Q9HC96 672 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 PARD6AQ9NPB6 346 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 ARL5AQ9Y689 179 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 C2orf81A6NN90 581 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 VILLO15195 856 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 CRTAMO95727 393 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 THEGLP0DJG4 465 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 CDK16Q00536 496 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 CSRP2Q16527 193 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 ANKRD22Q5VYY1 191 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 RAET1GQ6H3X3 334 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 Q6ZSR6 202 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 MAATS1Q7Z4T9 603 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 IQCHQ86VS3 1027 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 PELI3Q8N2H9 469 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 TRIM31Q9BZY9 425 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 FAM83DQ9H4H8 585 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 CASS4Q9NQ75 786 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 PKP3Q9Y446 797 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 K7ESM1 405 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 TLR4O00206 839 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 MAGEA6P43360 314 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 SARNPP82979 210 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 OVGP1Q12889 678 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 SEPT6Q14141 434 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 CERCAMQ5T4B2 595 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 ALS2CLQ60I27 953 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 PNCKQ6P2M8 343 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 MNS1Q8NEH6 495 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 FAM174AQ8TBP5 190 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 FAM122AQ96E09 287 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 DNAH14Q0VDD8 3507 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 RGSL1A5PLK6 1076 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 STX7O15400 261 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 RAD51CO43502 376 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 MAGEC1O60732 1142 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM63AO94886 807 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 BPIP17213 487 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 LPOP22079 712 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 GPR1P46091 355 aa22.27■■□□□ 1.16
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