RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000302101.5

NHLH1-201, Transcript of nescient helix-loop-helix 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NHLH1, Length 2,563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH1-201ENST00000302101 APCDD1Q8J025 514 aa22.14■■□□□ 1.14
NHLH1-201ENST00000302101 OR6Y1Q8NGX8 325 aa22.14■■□□□ 1.14
NHLH1-201ENST00000302101 ACTRT2Q8TDY3 377 aa22.14■■□□□ 1.14
NHLH1-201ENST00000302101 GBP5Q96PP8 586 aa22.14■■□□□ 1.14
NHLH1-201ENST00000302101 PRKD2Q9BZL6 878 aa22.14■■□□□ 1.14
NHLH1-201ENST00000302101 SCUBE2Q9NQ36 999 aa22.14■■□□□ 1.14
NHLH1-201ENST00000302101 VPS51Q9UID3 782 aa22.14■■□□□ 1.14
NHLH1-201ENST00000302101 HSPA4LO95757 839 aa22.14■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 CR2P20023 1033 aa22.14■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 CCDC153Q494R4 210 aa22.14■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 MPP7Q5T2T1 576 aa22.14■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 LPCAT4Q643R3 524 aa22.14■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 RNF111Q6ZNA4 994 aa22.14■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 HPS6Q86YV9 775 aa22.14■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa22.14■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 COG4Q9H9E3 785 aa22.14■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 CAB39LQ9H9S4 337 aa22.14■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 EPOP01588 193 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 PAMP19021 973 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 ITGAXP20702 1163 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 ARNTP27540 789 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 SPRP35270 261 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 SERPINB8P50452 374 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 BIRC2Q13490 618 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 DLG2Q15700 870 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 FSTL4Q6MZW2 842 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 LEMD2Q8NC56 503 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 HLA-DPA1P20036 260 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 IRF9Q00978 393 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 PRSS36Q5K4E3 855 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 PGM2L1Q6PCE3 622 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 NAPRTQ6XQN6 538 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 ING5Q8WYH8 240 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 PPP2R3CQ969Q6 453 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 RANBP9Q96S59 729 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 DPP7Q9UHL4 492 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 PRAMEF12O95522 483 aa22.12■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 POLE2P56282 527 aa22.12■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa22.12■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 DCAF4L2Q8NA75 395 aa22.12■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 ZSWIM3Q96MP5 696 aa22.12■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa22.12■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 POMPQ9Y244 141 aa22.12■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 ZBTB14O43829 449 aa22.12■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 MT-CO1P00395 513 aa22.12■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 CYBBP04839 570 aa22.12■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 FGF1P05230 155 aa22.12■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 LIMK2P53671 638 aa22.12■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa22.12■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 TSTD2Q5T7W7 516 aa22.12■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa22.12■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa22.11■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 A0A096LPK6 155 aa22.11■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 PEX2P28328 305 aa22.11■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 BTKQ06187 659 aa22.11■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 LMAN2Q12907 356 aa22.11■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 SFT2D3Q587I9 215 aa22.11■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 PDSS2Q86YH6 399 aa22.11■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 FIBINQ8TAL6 211 aa22.11■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 JADE3Q92613 823 aa22.11■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 TRIB3Q96RU7 358 aa22.11■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 SH3GL3Q99963 347 aa22.11■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 CDH19Q9H159 772 aa22.11■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 PIRTP0C851 137 aa22.11■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 CD70P32970 193 aa22.11■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 DENND6AQ8IWF6 608 aa22.11■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 MAPK15Q8TD08 544 aa22.11■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa22.11■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa22.11■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 K7ERQ8 282 aa22.1■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 NDST3O95803 873 aa22.1■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 COX4I1P13073 169 aa22.1■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 CES1P23141 567 aa22.1■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 CALRP27797 417 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 MAGEA12P43365 314 aa22.1■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 CTBP1Q13363 440 aa22.1■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 TMEM25Q86YD3 366 aa22.1■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 GALNT15Q8N3T1 639 aa22.1■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 LHX3Q9UBR4 397 aa22.1■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 MROH6A6NGR9 719 aa22.1■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 AQP4P55087 323 aa22.1■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 RHOAP61586 193 aa22.1■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 SLC14A2Q15849 920 aa22.1■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 ARMC3Q5W041 872 aa22.1■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 OR13J1Q8NGT2 312 aa22.1■■□□□ 1.13
NHLH1-201ENST00000302101 GDPD5Q8WTR4 605 aa22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms