RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 LGR4Q9BXB1 951 aa22.26■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 CD84Q9UIB8 345 aa22.26■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa22.26■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP22.26■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 AGTP01019 485 aa22.25■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 GIMD1P0DJR0 217 aa22.25■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 STIP1P31948 543 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 GEMP55040 296 aa22.25■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 KCTD11Q693B1 232 aa22.25■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 MACC1Q6ZN28 852 aa22.25■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa22.25■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 PARGQ86W56 976 aa22.25■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 AGAP2Q99490 1192 aa22.25■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 UCKL1Q9NWZ5 548 aa22.25■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 KCTD5Q9NXV2 234 aa22.25■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 SHOC2Q9UQ13 582 aa22.25■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 YKT6O15498 198 aa22.24■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 FLRT2O43155 660 aa22.24■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 SDC3O75056 442 aa22.24■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 PIAS2O75928 621 aa22.24■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 ANXA9O76027 345 aa22.24■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 STK10O94804 968 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 CEACAM1P13688 526 aa22.24■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 NME1P15531 152 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 DGKAP23743 735 aa22.24■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 SPINT3P49223 89 aa22.24■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 SNX1Q13596 522 aa22.24■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 NFATC4Q14934 902 aa22.24■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 PARP6Q2NL67 630 aa22.24■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 ZNF765Q7L2R6 523 aa22.24■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 PRUNE1Q86TP1 453 aa22.24■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 NRSN1Q8IZ57 195 aa22.24■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 SLC25A41Q8N5S1 370 aa22.24■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 GLIS1Q8NBF1 620 aa22.24■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 COG1Q8WTW3 980 aa22.24■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 MS4A14Q96JA4 679 aa22.24■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 TEX101Q9BY14 249 aa22.24■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa22.24■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 DNAJC28Q9NX36 388 aa22.24■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 ZNF711Q9Y462 761 aa22.24■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 LRP4O75096 1905 aa22.24■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 TMEM202A6NGA9 273 aa22.23■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 KIF5CO60282 957 aa22.23■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 ITGAVP06756 1048 aa22.23■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 ETS1P14921 441 aa22.23■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 TEAD1P28347 426 aa22.23■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 THOP1P52888 689 aa22.23■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 PTK2BQ14289 1009 aa22.23■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 LONRF2Q1L5Z9 754 aa22.23■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 PPM1JQ5JR12 505 aa22.23■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 DENND5AQ6IQ26 1287 aa22.23■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa22.23■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 TTC30BQ8N4P2 665 aa22.23■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 PRELID2Q8N945 189 aa22.23■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 AP2M1Q96CW1 435 aa22.23■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 PBKQ96KB5 322 aa22.23■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 FICDQ9BVA6 458 aa22.23■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa22.23■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 FUCA1P04066 466 aa22.22■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 TSHRP16473 764 aa22.22■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 HLA-DPA1P20036 260 aa22.22■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 KIAA1024LP59773 190 aa22.22■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 ALG11Q2TAA5 492 aa22.22■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 P3H1Q32P28 736 aa22.22■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 RBFAQ8N0V3 343 aa22.22■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 RHBDD1Q8TEB9 315 aa22.22■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 OSBPL9Q96SU4 736 aa22.22■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 KCND1Q9NSA2 647 aa22.22■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 ZNF148Q9UQR1 794 aa22.22■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 SCN8AQ9UQD0 1980 aa22.21■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 RGSL1A5PLK6 1076 aa22.21■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 FANCGO15287 622 aa22.21■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 JUNDP17535 347 aa22.21■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 KCNJ1P48048 391 aa22.21■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 SPARCL1Q14515 664 aa22.21■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 FAXCQ5TGI0 409 aa22.21■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 CCDC70Q6NSX1 233 aa22.21■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 ENPP7Q6UWV6 458 aa22.21■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa22.21■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 HEATR4Q86WZ0 1026 aa22.21■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 GPR26Q8NDV2 337 aa22.21■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 MAIP1Q8WWC4 291 aa22.21■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 APOL2Q9BQE5 337 aa22.21■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 SLC32A1Q9H598 525 aa22.21■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 WDR26Q9H7D7 661 aa22.21■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms