RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 GID8Q9NWU2 228 aa22.13■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 RHBDL2Q9NX52 303 aa22.13■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 E9PAM4 449 aa22.13■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 PDHXO00330 501 aa22.13■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 ACOX3O15254 700 aa22.13■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 CDH13P55290 713 aa22.13■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 LRRC43Q8N309 656 aa22.13■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 SH3RF2Q8TEC5 729 aa22.13■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 TWIST2Q8WVJ9 160 aa22.13■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 IL1RL2Q9HB29 575 aa22.13■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 RASAL1O95294 804 aa22.12■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 UGT1A6P19224 532 aa22.12■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 FDXRP22570 491 aa22.12■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 ARSDP51689 593 aa22.12■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 TRPV3Q8NET8 790 aa22.12■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 SCAMP5Q8TAC9 235 aa22.12■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 PKMYT1Q99640 499 aa22.12■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 HIPK3Q9H422 1215 aa22.12■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa22.12■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 AZIN1O14977 448 aa22.12■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 PIP5K1BO14986 540 aa22.12■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 GPIP06744 558 aa22.12■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 STT3AP46977 705 aa22.12■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 GRB7Q14451 532 aa22.12■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 PIM3Q86V86 326 aa22.12■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 COLGALT2Q8IYK4 626 aa22.12■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 NPLOC4Q8TAT6 608 aa22.12■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 MIPOL1Q8TD10 442 aa22.12■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 SEPT8Q92599 483 aa22.12■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 CASP10Q92851 521 aa22.12■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 HDAC10Q969S8 669 aa22.12■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 LRRC58Q96CX6 371 aa22.12■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 MUC13Q9H3R2 512 aa22.12■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 TMLHEQ9NVH6 421 aa22.12■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 MPP6Q9NZW5 540 aa22.12■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 EGFL7Q9UHF1 273 aa22.12■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 BPTFQ12830 3046 aa22.12■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM149AA5PLN7 773 aa22.11■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 RPL9P32969 192 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 RENBPP51606 427 aa22.11■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 C14orf80Q86SX3 495 aa22.11■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 MID1IP1Q9NPA3 183 aa22.11■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 RGS18Q9NS28 235 aa22.11■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 HS3ST4Q9Y661 456 aa22.11■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 SH3PXD2BA1X283 911 aa22.11■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 ARPC2O15144 300 aa22.11■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 MSI1O43347 362 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 MMP2P08253 660 aa22.11■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 FCGR1AP12314 374 aa22.11■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 TMED1Q13445 227 aa22.11■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 TMTC4Q5T4D3 741 aa22.11■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 LDLRAD1Q5T700 205 aa22.11■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 OR6P1Q8NGX9 317 aa22.11■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 TSPEARQ8WU66 669 aa22.11■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 HSPBAP1Q96EW2 488 aa22.11■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 DOK1Q99704 481 aa22.11■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa22.11■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 DYTNA2CJ06 578 aa22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 PPP6CO00743 305 aa22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 GFAPP14136 432 aa22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 LBPP18428 481 aa22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 CD86P42081 329 aa22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 MUC3BQ9H195 1237 aa22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 TUBB1Q9H4B7 451 aa22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM105AQ9NUU6 356 aa22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 TBCCD1Q9NVR7 557 aa22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 GIMAP2Q9UG22 337 aa22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 ODC1P11926 461 aa22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 OXTRP30559 389 aa22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 TTKP33981 857 aa22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 SUOXP51687 545 aa22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 FOXA1P55317 472 aa22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 IHHQ14623 411 aa22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 UPP1Q16831 310 aa22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 OR52K2Q8NGK3 314 aa22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 PAAF1Q9BRP4 392 aa22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 NT5MQ9NPB1 228 aa22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 OAZ3Q9UMX2 235 aa22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 MTHFD2P13995 350 aa22.1■■□□□ 1.13
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