RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216484.6

SPTLC2-201, Transcript of serine palmitoyltransferase long chain base subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPTLC2, Length 8,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC2-201ENST00000216484 OR3A2P47893 321 aa14.61□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 TTPAP49638 278 aa14.61□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 ARPC4P59998 168 aa14.61□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 LIPEQ05469 1076 aa14.61□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 BEND5Q7L4P6 421 aa14.61□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 CFAP97Q9P2B7 532 aa14.61□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 TULP3O75386 442 aa14.61□□□□□ -0.07
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SPTLC2-201ENST00000216484 COX4I1P13073 169 aa14.61□□□□□ -0.07
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SPTLC2-201ENST00000216484 TLR1Q15399 786 aa14.61□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 STXBP5Q5T5C0 1151 aa14.61□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 DHDDSQ86SQ9 333 aa14.61□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 ZNF700Q9H0M5 742 aa14.61□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 ITGA11Q9UKX5 1188 aa14.61□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 SPAG17Q6Q759 2223 aa14.61□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa14.61□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 RPL5P46777 297 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 CLCN3P51790 818 aa14.61□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 PPM1LQ5SGD2 360 aa14.61□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa14.61□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 KCTD4Q8WVF5 259 aa14.61□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 ZNF649Q9BS31 505 aa14.61□□□□□ -0.07
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SPTLC2-201ENST00000216484 TAPT1Q6NXT6 567 aa14.6□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 BRINP2Q9C0B6 783 aa14.6□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 KLHL26Q53HC5 615 aa14.6□□□□□ -0.07
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SPTLC2-201ENST00000216484 OR52K1Q8NGK4 314 aa14.6□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 KXD1Q9BQD3 176 aa14.6□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 ENY2Q9NPA8 101 aa14.6□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
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SPTLC2-201ENST00000216484 ZNF627Q7L945 461 aa14.6□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 OR4C6Q8NH72 309 aa14.6□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 NEDD1Q8NHV4 660 aa14.6□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 A0A087X0B3 334 aa14.6□□□□□ -0.07
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SPTLC2-201ENST00000216484 SNTG2Q9NY99 539 aa14.6□□□□□ -0.07
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SPTLC2-201ENST00000216484 ITGA7Q13683 1181 aa14.6□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 ALX1Q15699 326 aa14.6□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 SYVN1Q86TM6 617 aa14.6□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 CLPTM1LQ96KA5 538 aa14.6□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 SNTG1Q9NSN8 517 aa14.6□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa14.6□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 GDI2P50395 445 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 SF1Q15637 639 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 IDNKQ5T6J7 187 aa14.6□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 RNF43Q68DV7 783 aa14.6□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 RFKQ969G6 155 aa14.6□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.073e-6■■■□□ 17.3
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SPTLC2-201ENST00000216484 ATP7AQ04656 1500 aa14.6□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 RPTORQ8N122 1335 aa14.6□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 NDST1P52848 882 aa14.6□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 SCARF1Q14162 830 aa14.6□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa14.6□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 ADCY4Q8NFM4 1077 aa14.6□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 MCMBPQ9BTE3 642 aa14.6□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 DNPEPQ9ULA0 475 aa14.6□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 PDCD5O14737 125 aa14.59□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 TPST2O60704 377 aa14.59□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 CETPP11597 493 aa14.59□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 ABCG1P45844 678 aa14.59□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 DPYSQ14117 519 aa14.59□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 ANXA8L1Q5VT79 327 aa14.59□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa14.59□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 PPCDCQ96CD2 204 aa14.59□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
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