RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000054666.10

VAMP3-201, Transcript of vesicle associated membrane protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VAMP3, Length 2,205 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3-201ENST00000054666 FBXW8Q8N3Y1 598 aa8.26□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 PNPLA1Q8N8W4 532 aa8.26□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 KYQ8NBH2 561 aa8.26□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 L3HYPDHQ96EM0 354 aa8.26□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 ERVK-6Q9BXR3 956 aa8.26□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 RNF38Q9H0F5 515 aa8.26□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 ZBTB26Q9HCK0 441 aa8.26□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 BATF3Q9NR55 127 aa8.26□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 SPG21Q9NZD8 308 aa8.26□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 HACD3Q9P035 362 aa8.26□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa8.26□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 LRRC42Q9Y546 428 aa8.26□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 SPO11Q9Y5K1 396 aa8.26□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 INSL5Q9Y5Q6 135 aa8.26□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa8.25□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 BAG2O95816 211 aa8.25□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 JUNP05412 331 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
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VAMP3-201ENST00000054666 ART3Q13508 389 aa8.25□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 SQLEQ14534 574 aa8.25□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF678Q5SXM1 525 aa8.25□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 TMEM198Q66K66 360 aa8.25□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF549Q6P9A3 640 aa8.25□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 TMEM207Q6UWW9 146 aa8.25□□□□□ -1.09
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VAMP3-201ENST00000054666 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 PAF1Q8N7H5 531 aa8.25□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 RHEBL1Q8TAI7 183 aa8.25□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 SLC26A7Q8TE54 656 aa8.25□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP8.25□□□□□ -1.09
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VAMP3-201ENST00000054666 MARK4Q96L34 752 aa8.25□□□□□ -1.09
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VAMP3-201ENST00000054666 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP8.25□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 TMEM39AQ9NV64 488 aa8.25□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 BCAP29Q9UHQ4 241 aa8.25□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 STOML2Q9UJZ1 356 aa8.25□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa8.25□□□□□ -1.09
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VAMP3-201ENST00000054666 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa8.25□□□□□ -1.09
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VAMP3-201ENST00000054666 MC4RP32245 332 aa8.25□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 PPM1AP35813 382 aa8.25□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 ERFP50548 548 aa8.25□□□□□ -1.09
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VAMP3-201ENST00000054666 STX1BP61266 288 aa8.25□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 ATP6V0D1P61421 351 aa8.25□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa8.25□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 PPM1LQ5SGD2 360 aa8.25□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 PGM2L1Q6PCE3 622 aa8.25□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 LINGO4Q6UY18 593 aa8.25□□□□□ -1.09
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VAMP3-201ENST00000054666 MFN1Q8IWA4 741 aa8.25□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 TCEAL8Q8IYN2 117 aa8.25□□□□□ -1.09
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VAMP3-201ENST00000054666 PGAM4Q8N0Y7 254 aa8.25□□□□□ -1.09
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VAMP3-201ENST00000054666 TTC16Q8NEE8 873 aa8.25□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 STAG3L4Q8TBR4 150 aa8.25□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 LPGAT1Q92604 370 aa8.25□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 TOP1MTQ969P6 601 aa8.25□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 FAM136AQ96C01 138 aa8.25□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 RCN3Q96D15 328 aa8.25□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 DERL2Q9GZP9 239 aa8.25□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 VCX3BQ9H321 246 aa8.25□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 GSTO2Q9H4Y5 243 aa8.25□□□□□ -1.09
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VAMP3-201ENST00000054666 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 TBX21Q9UL17 535 aa8.25□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 RNF112Q9ULX5 631 aa8.25□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 MAFFQ9ULX9 164 aa8.25□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 FAM50BQ9Y247 325 aa8.25□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 PKP3Q9Y446 797 aa8.25□□□□□ -1.09
VAMP3-201ENST00000054666 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa8.25□□□□□ -1.09
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