RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PuraP42669 321 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prox1P48437 737 aa17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ArsaP50428 506 aa17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 SPINDOCQ05AH6 381 aa17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nol9Q3TZX8 714 aa17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rab26Q504M8 260 aa17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CcncQ62447 283 aa17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Casc4Q6P2L7 435 aa17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr1198Q7TR12 308 aa17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fstl5Q8BFR2 847 aa17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ofcc1Q8BGX4 166 aa17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vps26bQ8C0E2 336 aa17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trpv3Q8K424 791 aa17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CtbsQ8R242 366 aa17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pcdhgc3Q91XX1 934 aa17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mrps5Q99N87 432 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 NvlQ9DBY8 855 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Igkv10-96A0A140T8M1 115 aa17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc120A2AEV7 629 aa17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn2r86G5E8Y4 848 aa17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm3383J3QQ59 259 aa17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm3239L7N2D9 227 aa17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CenpaO35216 134 aa17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Spp1P10923 294 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gucy2eP52785 1108 aa17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cdkn2bP55271 130 aa17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ubtfl1Q3USZ2 394 aa17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hmgxb4Q80Y32 594 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zswim3Q8CFL8 695 aa17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gspt1Q8R050 636 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm3147A0A0J9YU88 481 aa17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm10424A0A0J9YVD0 481 aa17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Arhgap36B1AUC7 590 aa17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 5830411N06RikB3F5L4 1112 aa17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm7971J3QMM8 481 aa17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rgs2O08849 211 aa17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ldb2O55203 373 aa17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc6a20bO88575 635 aa17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fbln2P37889 1221 aa17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gp1bbP56400 206 aa17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pip5k1bP70181 539 aa17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sephs2P97364 452 aa17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CtscP97821 462 aa17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 F8a1Q00558 380 aa17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tfap2cQ61312 449 aa17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tead4Q62296 427 aa17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmcc2Q80W04 706 aa17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gxylt2Q810K9 444 aa17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Noc4lQ8BHY2 516 aa17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc6a20aQ8VDB9 592 aa17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dennd2dQ91VV4 469 aa17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mrps2Q924T2 291 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sdcbp2Q99JZ0 292 aa17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Aco2Q99KI0 780 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lrrc40Q9CRC8 602 aa17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pbld2Q9CXN7 288 aa17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Oxct2bQ9ESL0 520 aa17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Jam2Q9JI59 298 aa17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Oxct2aQ9JJN4 520 aa17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr839-ps1A0A1D5RMH6 312 aa17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Aldoart1A6ZI46 419 aa17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ceacam3E9Q6J4 706 aa17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Spata31E9QAF0 1014 aa17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hs3st1O35310 311 aa17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kcnk4O88454 398 aa17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam167bP17257 162 aa17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CtsdP18242 410 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lhx3P50481 400 aa17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Defa8P50706 81 aa17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc45a4Q0P5V9 785 aa17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lmf1Q3U3R4 574 aa17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sh2d1b2Q45HK4 132 aa17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Caprin1Q60865 707 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmem220Q8BP07 167 aa17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc32Q8BS39 179 aa17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fmo9Q8C116 539 aa17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tp53bp2Q8CG79 1128 aa17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tspan33Q8R3S2 283 aa17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Itfg1Q99KW9 610 aa17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rsl24d1Q99L28 163 aa17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ddx50Q99MJ9 734 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kif19Q99PT9 997 aa17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Glod4Q9CPV4 298 aa17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rnaseh2aQ9CWY8 301 aa17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Armc1Q9D7A8 282 aa17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ndst3Q9EQH7 873 aa17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Plxna3P70208 1872 aa17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kif26aQ52KG5 1881 aa17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr1200A2ATJ4 336 aa17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 F830016B08RikG3UWE2 416 aa17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Il4i1O09046 630 aa17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp14P10755 501 aa17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pou4f1P17208 421 aa17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tgm2P21981 686 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AxlQ00993 888 aa17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam131bQ3TY60 332 aa17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 BtrcQ3ULA2 605 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Jak2Q62120 1129 aa17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cdc14bQ6PFY9 485 aa17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sox11Q7M6Y2 395 aa17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.3 ms