RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635397.1

SMARCA2-241, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2, humanhuman

TSL 4

Gene SMARCA2, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2-241ENST00000635397 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 LDB2O43679 373 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 ENTPD3O75355 529 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 TPPPO94811 219 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 PRF1P14222 555 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 CD58P19256 250 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 NRIP1P48552 1158 aa5.51□□□□□ -1.53
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SMARCA2-241ENST00000635397 SYCE2Q6PIF2 218 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 CLEC17AQ6ZS10 378 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 PIP4P1Q86T03 277 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 DNAJC10Q8IXB1 793 aa5.51□□□□□ -1.53
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SMARCA2-241ENST00000635397 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 NDST4Q9H3R1 872 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 TMEM51Q9NW97 253 aa5.51□□□□□ -1.53
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SMARCA2-241ENST00000635397 ZNF804BA4D1E1 1349 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 C1orf226A1L170 272 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 MS4A18H0YCH9 400 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 H0YGN5 161 aa5.5□□□□□ -1.53
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SMARCA2-241ENST00000635397 CYP1A2P05177 515 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 TUBBP07437 444 aa5.5□□□□□ -1.53
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SMARCA2-241ENST00000635397 SELLP14151 372 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 ARSBP15848 533 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 PON1P27169 355 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 PIGAP37287 484 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 THPOP40225 353 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 ENTPD1P49961 510 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 ZP1P60852 638 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP5.5□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 ST3GAL1Q11201 340 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 MYBPC2Q14324 1141 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 GPR18Q14330 331 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 NTRK2Q16620 822 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 PCGF3Q3KNV8 242 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 ALDH1L2Q3SY69 923 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 MMEL1Q495T6 779 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 BMP2KLQ5H9B9 411 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 PXDC1Q5TGL8 231 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 PMS2CLQ68D20 193 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 PQLC2Q6ZP29 291 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 CFAP77Q6ZQR2 320 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 ZNF367Q7RTV3 350 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 ANKRD23Q86SG2 305 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 C7orf57Q8NEG2 295 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 AGBL3Q8NEM8 1001 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 NLRP4Q96MN2 994 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 CRAMP1Q96RY5 1269 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 PCGF1Q9BSM1 259 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 RCOR1Q9UKL0 485 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 BTBD3Q9Y2F9 522 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 STON1Q9Y6Q2 735 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 H3BQ06 376 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 I6L893 689 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 VCYO14598 125 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 ITM2AO43736 263 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 GPC4O75487 556 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 JRKO75564 520 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 CYC1P08574 325 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 IL11P20809 199 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 GNLYP22749 145 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 GPTP24298 496 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 RRP1P56182 461 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 ADORA2A-AS1P86434 159 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 PRTGQ2VWP7 1150 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 CCDC184Q52MB2 194 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 LRIF1Q5T3J3 769 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 ANKRD54Q6NXT1 300 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 SLC30A6Q6NXT4 461 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCA2-241ENST00000635397 Q6ZTK2 550 aa5.49□□□□□ -1.53
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