RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625905.1

NELFE-214, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NELFE, Length 111 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-214ENST00000625905 TRIB3Q96RU7 358 aa9.23□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 LYSMD1Q96S90 227 aa9.23□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 TLR10Q9BXR5 811 aa9.23□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 WDR26Q9H7D7 661 aa9.23□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 DNAJC28Q9NX36 388 aa9.23□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa9.23□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 UBP1Q9NZI7 540 aa9.23□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 PPIL1Q9Y3C6 166 aa9.23□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 SPTBN4Q9H254 2564 aa9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 A0A0U1RQS6 177 aa9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 ANKRD66B4E2M5 251 aa9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 ENC1O14682 589 aa9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 LIASO43766 372 aa9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 SH3BP5O60239 455 aa9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 CEP104O60308 925 aa9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 SDC3O75056 442 aa9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 ANXA9O76027 345 aa9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 ITGAVP06756 1048 aa9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 C1SP09871 688 aa9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 NME1P15531 152 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 GM2AP17900 193 aa9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 PSMB4P28070 264 aa9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 GRK6P43250 576 aa9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 RXRGP48443 463 aa9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 STC1P52823 247 aa9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 GEMP55040 296 aa9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 MPP3Q13368 585 aa9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 FZD2Q14332 565 aa9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 PRPSAP1Q14558 356 aa9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 INPP5AQ14642 412 aa9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 NFATC4Q14934 902 aa9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 SHBQ15464 509 aa9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 ZNF569Q5MCW4 686 aa9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 TPRG1LQ5T0D9 272 aa9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 RAET1GQ6H3X3 334 aa9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 KDELC1Q6UW63 502 aa9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 Q6ZVL8 140 aa9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 PIP4P1Q86T03 277 aa9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 GATAD2AQ86YP4 633 aa9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 REXO1L1PQ8IX06 675 aa9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 FAM71DQ8N9W8 422 aa9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 ATL2Q8NHH9 583 aa9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 SLC35B2Q8TB61 432 aa9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 CCDC110Q8TBZ0 833 aa9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 CCHCR1Q8TD31 782 aa9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 KCTD5Q9NXV2 234 aa9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 ZNF711Q9Y462 761 aa9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 JRKLQ9Y4A0 524 aa9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 OR1A2Q9Y585 309 aa9.22□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 DMXL1Q9Y485 3027 aa9.21□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 KNL1Q8NG31 2342 aa9.21□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa9.21□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 C5orf60A6NFR6 353 aa9.21□□□□□ -0.94
NELFE-214ENST00000625905 KCNK5O95279 499 aa9.21□□□□□ -0.94
NELFE-214ENST00000625905 FGGP02679 453 aa9.21□□□□□ -0.94
NELFE-214ENST00000625905 FGF1P05230 155 aa9.21□□□□□ -0.94
NELFE-214ENST00000625905 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
NELFE-214ENST00000625905 PIRTP0C851 137 aa9.21□□□□□ -0.94
NELFE-214ENST00000625905 CEACAM1P13688 526 aa9.21□□□□□ -0.94
NELFE-214ENST00000625905 TSHRP16473 764 aa9.21□□□□□ -0.94
NELFE-214ENST00000625905 HLA-DPA1P20036 260 aa9.21□□□□□ -0.94
NELFE-214ENST00000625905 KELP23276 732 aa9.21□□□□□ -0.94
NELFE-214ENST00000625905 CXCR5P32302 372 aa9.21□□□□□ -0.94
NELFE-214ENST00000625905 GDF10P55107 478 aa9.21□□□□□ -0.94
NELFE-214ENST00000625905 KIAA1024LP59773 190 aa9.21□□□□□ -0.94
NELFE-214ENST00000625905 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP9.21□□□□□ -0.94
NELFE-214ENST00000625905 P3H1Q32P28 736 aa9.21□□□□□ -0.94
NELFE-214ENST00000625905 ZNF542PQ5EBM4 170 aa9.21□□□□□ -0.94
NELFE-214ENST00000625905 ZNF765Q7L2R6 523 aa9.21□□□□□ -0.94
NELFE-214ENST00000625905 HEATR4Q86WZ0 1026 aa9.21□□□□□ -0.94
NELFE-214ENST00000625905 PHACTR4Q8IZ21 702 aa9.21□□□□□ -0.94
NELFE-214ENST00000625905 SLC35F6Q8N357 371 aa9.21□□□□□ -0.94
NELFE-214ENST00000625905 SLC25A41Q8N5S1 370 aa9.21□□□□□ -0.94
NELFE-214ENST00000625905 PLA2G15Q8NCC3 412 aa9.21□□□□□ -0.94
NELFE-214ENST00000625905 SAP25Q8TEE9 199 aa9.21□□□□□ -0.94
NELFE-214ENST00000625905 MAIP1Q8WWC4 291 aa9.21□□□□□ -0.94
NELFE-214ENST00000625905 C1orf54Q8WWF1 131 aa9.21□□□□□ -0.94
NELFE-214ENST00000625905 LRRC45Q96CN5 670 aa9.21□□□□□ -0.94
NELFE-214ENST00000625905 AP2M1Q96CW1 435 aa9.21□□□□□ -0.94
NELFE-214ENST00000625905 MRGPRX2Q96LB1 330 aa9.21□□□□□ -0.94
NELFE-214ENST00000625905 WDR92Q96MX6 357 aa9.21□□□□□ -0.94
NELFE-214ENST00000625905 CAMK1GQ96NX5 476 aa9.21□□□□□ -0.94
NELFE-214ENST00000625905 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
NELFE-214ENST00000625905 TMEM121Q9BTD3 319 aa9.21□□□□□ -0.94
NELFE-214ENST00000625905 APOOQ9BUR5 198 aa9.21□□□□□ -0.94
NELFE-214ENST00000625905 FICDQ9BVA6 458 aa9.21□□□□□ -0.94
NELFE-214ENST00000625905 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa9.21□□□□□ -0.94
NELFE-214ENST00000625905 USP29Q9HBJ7 922 aa9.21□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms