RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 SLC5A2P31639 672 aa22.1■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 SRP54P61011 504 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 TPM4P67936 248 aa22.1■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 ZNF235Q14590 738 aa22.1■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 LINC00303Q3SY05 128 aa22.1■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 ENPP7Q6UWV6 458 aa22.1■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 NYAP1Q6ZVC0 841 aa22.1■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 USP53Q70EK8 1073 aa22.1■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 FAM71BQ8TC56 605 aa22.1■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 HSPH1Q92598 858 aa22.1■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 PDXPQ96GD0 296 aa22.1■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 NUDCD1Q96RS6 583 aa22.1■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 STRADBQ9C0K7 418 aa22.1■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 PCDH18Q9HCL0 1135 aa22.1■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 EPB41L5Q9HCM4 733 aa22.1■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 STARD5Q9NSY2 213 aa22.1■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 IP6K2Q9UHH9 426 aa22.1■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 CAPN11Q9UMQ6 739 aa22.1■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 NENFQ9UMX5 172 aa22.1■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 A0A087X0T9 212 aa22.09■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 A0A1W2PQ67 120 aa22.09■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 FAM228BP0C875 321 aa22.09■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 SERPINB6P35237 376 aa22.09■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 TRIM23P36406 574 aa22.09■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 UBASH3AP57075 661 aa22.09■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 RALGPS1Q5JS13 557 aa22.09■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 KCTD16Q68DU8 428 aa22.09■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 ATG14Q6ZNE5 492 aa22.09■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 PGBD5Q8N414 524 aa22.09■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 FBXO39Q8N4B4 442 aa22.09■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 KYQ8NBH2 561 aa22.09■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 NUP85Q9BW27 656 aa22.09■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 ANAPC7Q9UJX3 599 aa22.09■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 CASC3O15234 703 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 EFSO43281 561 aa22.08■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 GYPCP04921 128 aa22.08■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 LIPCP11150 499 aa22.08■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 CTSEP14091 401 aa22.08■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 UGT1A5P35504 534 aa22.08■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 RAB11FIP2Q7L804 512 aa22.08■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 GKN2Q86XP6 184 aa22.08■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 JAMLQ86YT9 394 aa22.08■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 ATPAF2Q8N5M1 289 aa22.08■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 COQ10AQ96MF6 247 aa22.08■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 FGF22Q9HCT0 170 aa22.08■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 B4GALT6Q9UBX8 382 aa22.08■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa22.07■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 TNFRSF10CO14798 259 aa22.07■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 SFTPCP11686 197 aa22.07■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 INHBCP55103 352 aa22.07■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 CDH6P55285 790 aa22.07■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 CNGA3Q16281 694 aa22.07■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa22.07■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 OR56A4Q8NGH8 313 aa22.07■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 OR1E3Q8WZA6 343 aa22.07■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 EXTL1Q92935 676 aa22.07■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 CCDC74AQ96AQ1 378 aa22.07■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 BTBD6Q96KE9 485 aa22.07■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 DOLKQ9UPQ8 538 aa22.07■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 TMEM202A6NGA9 273 aa22.06■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 KELP23276 732 aa22.06■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 IL4RP24394 825 aa22.06■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 CCKBRP32239 447 aa22.06■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 ARSEP51690 589 aa22.06■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 TRAF2Q12933 501 aa22.06■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 LRRC49Q8IUZ0 686 aa22.06■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 PELI3Q8N2H9 469 aa22.06■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 BBS5Q8N3I7 341 aa22.06■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 TMEM74Q96NL1 305 aa22.06■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 WDR26Q9H7D7 661 aa22.06■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 NOD2Q9HC29 1040 aa22.06■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 KCTD5Q9NXV2 234 aa22.06■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 SEPT10Q9P0V9 454 aa22.06■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 GPR34Q9UPC5 381 aa22.06■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa22.06■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 NOBOXO60393 691 aa22.05■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 CPP00450 1065 aa22.05■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 TNFP01375 233 aa22.05■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 JMJD7P0C870 316 aa22.05■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 VIPR1P32241 457 aa22.05■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 MMP13P45452 471 aa22.05■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 PNCKQ6P2M8 343 aa22.05■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 RD3Q7Z3Z2 195 aa22.05■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 TEX26Q8N6G2 289 aa22.05■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 PAF1Q8N7H5 531 aa22.05■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 GPR156Q8NFN8 814 aa22.05■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 OR6C4Q8NGE1 309 aa22.05■■□□□ 1.12
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