RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613916.1

PVT1-222, Transcript of Pvt1 oncogene, human

Gene PVT1, Length 137 nt, Biotype misc RNA, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PVT1-222	ENST00000613916	KRT15	P19012	456 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	ATP5D	P30049	168 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	GDI1	P31150	447 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	GP5	P40197	560 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	CCNF	P41002	786 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	SERPINB9	P50453	376 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	GUCY1A3	Q02108	690 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	BCL2L1	Q07817	233 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	HTR4	Q13639	388 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	BMPR2	Q13873	1038 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	CDKN3	Q16667	212 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916		Q6ZVU0	165 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	CPA6	Q8N4T0	437 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	PJA1	Q8NG27	643 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	TTC8	Q8TAM2	541 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	STYX	Q8WUJ0	223 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	SPOCK2	Q92563	424 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	CDKL2	Q92772	493 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	PTPRN2	Q92932	1015 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	PEX13	Q92968	403 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	HDAC10	Q969S8	669 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	EID2B	Q96D98	161 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	DNAJC1	Q96KC8	554 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	TBATA	Q96M53	351 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	RBBP8	Q99708	897 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	CPNE1	Q99829	537 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	MTG2	Q9H4K7	406 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	SENP1	Q9P0U3	644 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	ZFAT	Q9P243	1243 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	DEC1	Q9P2X7	70 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916		A0A0J9YYE9	177 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	TMEM120B	A0PK00	339 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	OR51F1	A6NGY5	319 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	GOLGA8R	I6L899	631 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	SLC7A4	O43246	635 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	LILRB5	O75023	590 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	KRT38	O76015	456 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	TRBC1	P01850	177 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	AHSG	P02765	367 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	ITGA2B	P08514	1039 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	ALPI	P09923	528 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	CHN1	P15882	459 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	CTPS1	P17812	591 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	KRT4	P19013	534 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	CNTF	P26441	200 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	ABL2	P42684	1182 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	SLC1A2	P43004	574 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	MAGEA12	P43365	314 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	ABCG1	P45844	678 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	MAPK8	P45983	427 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	GRIA4	P48058	902 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	CSRP3	P50461	194 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	NEK3	P51956	506 aa		7.34	□□□□□ -1.23

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