RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	LGALS16	A8MUM7	142 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	DFFA	O00273	331 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	SUV39H1	O43463	412 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	CPNE6	O95741	557 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	FGF1	P05230	155 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	CEACAM5	P06731	702 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	CCNB1	P14635	433 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	LHCGR	P22888	699 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	KEL	P23276	732 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	CSF2RB	P32927	897 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	HTR7	P34969	479 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	BCL2L1	Q07817	233 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	NR1D2	Q14995	579 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	ACOX1	Q15067	660 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	PTPRR	Q15256	657 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	RFX8	Q6ZV50	586 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	NEK11	Q8NG66	645 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	NUS1	Q96E22	293 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	SYT11	Q9BT88	431 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	FANCL	Q9NW38	375 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	ECEL1	O95672	775 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	ERCC2	P18074	760 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	PSMA2	P25787	234 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	CD1C	P29017	333 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	ALDH4A1	P30038	563 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	ETV3	P41162	512 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	GNPDA1	P46926	289 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	SCNN1B	P51168	640 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	AP1S1	P61966	158 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	IL10RB	Q08334	325 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	MAMLD1	Q13495	774 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	PIM3	Q86V86	326 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	PGBD5	Q8N414	524 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	PAF1	Q8N7H5	531 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	SPOCK2	Q92563	424 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	PSKH2	Q96QS6	385 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	TEX101	Q9BY14	249 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	SUFU	Q9UMX1	484 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A0U1RQS6	177 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	PEX11B	O96011	259 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	CR2	P20023	1033 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	TNFAIP3	P21580	790 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	CD82	P27701	267 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	POLD2	P49005	469 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	CDK3	Q00526	305 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	TRAF2	Q12933	501 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	DPYS	Q14117	519 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	DENND2C	Q68D51	928 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	XKR5	Q6UX68	686 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	NAGS	Q8N159	534 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	NKD1	Q969G9	470 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	DTD2	Q96FN9	168 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	SEMA3C	Q99985	751 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		11.92	□□□□□ -0.5

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