RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588419.1

HDAC5-208, Transcript of histone deacetylase 5, human

TSL 2

Gene HDAC5, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC5-208	ENST00000588419	AMPD1	P23109	780 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	ALDH4A1	P30038	563 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	VIPR1	P32241	457 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	ETV3	P41162	512 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	TYRO3	Q06418	890 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	NFATC3	Q12968	1075 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	DPYS	Q14117	519 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	MANEA	Q5SRI9	462 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	AFMID	Q63HM1	303 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	BBS5	Q8N3I7	341 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	USP7	Q93009	1102 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	MED8	Q96G25	268 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	CMKLR1	Q99788	373 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419		B8ZZF3	427 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	KALRN	O60229	2985 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	SKIL	P12757	684 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	CCNB1	P14635	433 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	TCF4	P15884	667 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	CTPS1	P17812	591 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	NFKBIA	P25963	317 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	GJC1	P36383	396 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	OR1D5	P58170	312 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	ITK	Q08881	620 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	13.71	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	13.71	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	TRAF2	Q12933	501 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	PTPRR	Q15256	657 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	PATE1	Q8WXA2	126 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	EXTL1	Q92935	676 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	COQ10A	Q96MF6	247 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	PSKH2	Q96QS6	385 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	SYT11	Q9BT88	431 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	TRIM4	Q9C037	500 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	CD84	Q9UIB8	345 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	APPL1	Q9UKG1	709 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	SUFU	Q9UMX1	484 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDAC5-208	ENST00000588419	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
HDAC5-208	ENST00000588419	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HDAC5-208	ENST00000588419		A0A0U1RQS6	177 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HDAC5-208	ENST00000588419	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
HDAC5-208	ENST00000588419	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	13.7	□□□□□ -0.22
HDAC5-208	ENST00000588419	TNFRSF10C	O14798	259 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HDAC5-208	ENST00000588419	EFS	O43281	561 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HDAC5-208	ENST00000588419	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
HDAC5-208	ENST00000588419	SOCS5	O75159	536 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HDAC5-208	ENST00000588419	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
HDAC5-208	ENST00000588419	ECEL1	O95672	775 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HDAC5-208	ENST00000588419	LHCGR	P22888	699 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HDAC5-208	ENST00000588419	IL1R2	P27930	398 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HDAC5-208	ENST00000588419	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
HDAC5-208	ENST00000588419	POLD2	P49005	469 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HDAC5-208	ENST00000588419	CDK3	Q00526	305 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HDAC5-208	ENST00000588419	KRT81	Q14533	505 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HDAC5-208	ENST00000588419	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HDAC5-208	ENST00000588419	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HDAC5-208	ENST00000588419	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HDAC5-208	ENST00000588419	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
HDAC5-208	ENST00000588419	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HDAC5-208	ENST00000588419	PIM3	Q86V86	326 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HDAC5-208	ENST00000588419	PGBD5	Q8N414	524 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HDAC5-208	ENST00000588419	LZTR1	Q8N653	840 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HDAC5-208	ENST00000588419	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HDAC5-208	ENST00000588419	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms