RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588340.1

EFTUD2-210, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-210ENST00000588340 MMP12P39900 470 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-210ENST00000588340 LIG3P49916 1009 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-210ENST00000588340 SCNN1BP51168 640 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-210ENST00000588340 RENBPP51606 427 aa6.89□□□□□ -1.31
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EFTUD2-210ENST00000588340 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
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EFTUD2-210ENST00000588340 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
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EFTUD2-210ENST00000588340 GUCA1BQ9UMX6 200 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-210ENST00000588340 LHX6Q9UPM6 363 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-210ENST00000588340 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-210ENST00000588340 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-210ENST00000588340 A0A1W2PQ67 120 aa6.87□□□□□ -1.31
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