RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 TLK1Q9UKI8 766 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-204ENST00000587718 NUP205Q92621 2012 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-204ENST00000587718 DENND4CQ5VZ89 1909 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-204ENST00000587718 HEATR9A2RTY3 570 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-204ENST00000587718 CRABP2P29373 138 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-204ENST00000587718 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-204ENST00000587718 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-204ENST00000587718 IL10RBQ08334 325 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-204ENST00000587718 ASPHQ12797 758 aa25.55■■□□□ 1.68
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CAPNS1-204ENST00000587718 SLC14A2Q15849 920 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-204ENST00000587718 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-204ENST00000587718 C5orf22Q49AR2 442 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-204ENST00000587718 C10orf107Q8IVU9 208 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-204ENST00000587718 SPEM1Q8N4L4 309 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM13CQ8NE31 585 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-204ENST00000587718 SPATA22Q8NHS9 363 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-204ENST00000587718 AGAP11Q8TF27 550 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-204ENST00000587718 OVCA2Q8WZ82 227 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-204ENST00000587718 PEX13Q92968 403 aa25.55■■□□□ 1.68
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CAPNS1-204ENST00000587718 CHFRQ96EP1 664 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-204ENST00000587718 MRGPRX2Q96LB1 330 aa25.55■■□□□ 1.68
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CAPNS1-204ENST00000587718 NMUR2Q9GZQ4 415 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-204ENST00000587718 NMRAL1Q9HBL8 299 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-204ENST00000587718 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
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CAPNS1-204ENST00000587718 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-204ENST00000587718 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-204ENST00000587718 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-204ENST00000587718 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
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CAPNS1-204ENST00000587718 CCNG1P51959 295 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC12A1Q13621 1099 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-204ENST00000587718 LRRC32Q14392 662 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-204ENST00000587718 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-204ENST00000587718 PPM1JQ5JR12 505 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-204ENST00000587718 DGKKQ5KSL6 1271 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-204ENST00000587718 TMPRSS6Q8IU80 811 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC22A12Q96S37 553 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-204ENST00000587718 C20orf27Q9GZN8 174 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-204ENST00000587718 C1orf21Q9H246 121 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-204ENST00000587718 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-204ENST00000587718 MARCH2Q9P0N8 246 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-204ENST00000587718 TAGLN3Q9UI15 199 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-204ENST00000587718 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-204ENST00000587718 TRIM13O60858 407 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-204ENST00000587718 TPH1P17752 444 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-204ENST00000587718 SATB1Q01826 763 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-204ENST00000587718 PON2Q15165 354 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-204ENST00000587718 MARC1Q5VT66 337 aa25.53■■□□□ 1.68
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CAPNS1-204ENST00000587718 MPP6Q9NZW5 540 aa25.52■■□□□ 1.68
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CAPNS1-204ENST00000587718 SPTBN4Q9H254 2564 aa25.52■■□□□ 1.68
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
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CAPNS1-204ENST00000587718 DOCK4Q8N1I0 1966 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 POU4F1Q01851 419 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 SNX30Q5VWJ9 437 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 SYNPOQ8N3V7 929 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 SP110Q9HB58 689 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 OXSMQ9NWU1 459 aa25.51■■□□□ 1.67
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