RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586268.5

NEDD4L-215, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3

Gene NEDD4L, Length 830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-215	ENST00000586268	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	DEFB123	Q8N688	67 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	TMIE	Q8NEW7	156 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	GPR150	Q8NGU9	434 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	PPM1E	Q8WY54	764 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	HDAC10	Q969S8	669 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	SCRN2	Q96FV2	425 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	MSANTD3	Q96H12	275 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	SGSM3	Q96HU1	749 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	TBATA	Q96M53	351 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	SMIM14	Q96QK8	99 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	AGAP2	Q99490	1192 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	RBBP8	Q99708	897 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	MTG2	Q9H4K7	406 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	HCN2	Q9UL51	889 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	FAM50B	Q9Y247	325 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	MT-ND3	P03897	115 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	GLUL	P15104	373 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	HNF1B	P35680	557 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	HMGCL	P35914	325 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	HADHA	P40939	763 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	IL12RB1	P42701	662 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	PFKP	Q01813	784 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	STK40	Q8N2I9	435 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	ZNF366	Q8N895	744 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	SMC6	Q96SB8	1091 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	IL17C	Q9P0M4	197 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-215	ENST00000586268	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		13.96	□□□□□ -0.18
NEDD4L-215	ENST00000586268	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-215	ENST00000586268		A0A1W2PPM1	405 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-215	ENST00000586268	HMX2	A2RU54	273 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-215	ENST00000586268	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-215	ENST00000586268	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-215	ENST00000586268	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-215	ENST00000586268	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-215	ENST00000586268	ITGA2B	P08514	1039 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-215	ENST00000586268	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-215	ENST00000586268	BMP1	P13497	986 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-215	ENST00000586268	HLA-E	P13747	358 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-215	ENST00000586268	BRAF	P15056	766 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-215	ENST00000586268	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-215	ENST00000586268	CCNF	P41002	786 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-215	ENST00000586268	SLC1A2	P43004	574 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-215	ENST00000586268	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-215	ENST00000586268	TMPRSS15	P98073	1019 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-215	ENST00000586268	BMPR2	Q13873	1038 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-215	ENST00000586268	PTPRCAP	Q14761	206 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-215	ENST00000586268	PTPRR	Q15256	657 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-215	ENST00000586268	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-215	ENST00000586268	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-215	ENST00000586268	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-215	ENST00000586268	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-215	ENST00000586268	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-215	ENST00000586268	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-215	ENST00000586268	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-215	ENST00000586268	ISL2	Q96A47	359 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-215	ENST00000586268	KCNK17	Q96T54	332 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-215	ENST00000586268	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-215	ENST00000586268	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-215	ENST00000586268	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-215	ENST00000586268	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-215	ENST00000586268	PKP3	Q9Y446	797 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-215	ENST00000586268	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-215	ENST00000586268	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-215	ENST00000586268	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NEDD4L-215	ENST00000586268		K7EQS6	105 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NEDD4L-215	ENST00000586268	CCL22	O00626	93 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NEDD4L-215	ENST00000586268	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	13.94	□□□□□ -0.18	5e-6	■■■□□ 14.8
NEDD4L-215	ENST00000586268	SLC4A1	P02730	911 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NEDD4L-215	ENST00000586268	TIMP2	P16035	220 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NEDD4L-215	ENST00000586268	ZNF30	P17039	623 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NEDD4L-215	ENST00000586268	DRD1	P21728	446 aa		13.94	□□□□□ -0.18

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