RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579743.2

GGA3-208, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 4

Gene GGA3, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-208	ENST00000579743	PYGL	P06737	847 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	RARA	P10276	462 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	EPHB1	P54762	984 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	CCL7	P80098	99 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	JAML	Q86YT9	394 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	GPR156	Q8NFN8	814 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	SCRN2	Q96FV2	425 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	CMKLR1	Q99788	373 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	MGME1	Q9BQP7	344 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	NUP85	Q9BW27	656 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	PTMS	P20962	102 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	IL1R2	P27930	398 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	CCKBR	P32239	447 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	FANCC	Q00597	558 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	IQCB1	Q15051	598 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	CLEC14A	Q86T13	490 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	KCTD6	Q8NC69	237 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	COQ10A	Q96MF6	247 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	THAP2	Q9H0W7	228 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	NOD2	Q9HC29	1040 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	FGF22	Q9HCT0	170 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	AMACR	Q9UHK6	382 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	RP1	P56715	2156 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	PGLS	O95336	258 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	CYP1A2	P05177	515 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	KRT7	P08729	469 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	CCNB1	P14635	433 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF30	P17039	623 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	CR2	P20023	1033 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	TEAD1	P28347	426 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	GPR1	P46091	355 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	PDK2	Q15119	407 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	CNGA3	Q16281	694 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF605	Q86T29	641 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	PIM3	Q86V86	326 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	DTD2	Q96FN9	168 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	TEX101	Q9BY14	249 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	CDH19	Q9H159	772 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	CBX8	Q9HC52	389 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	NT5M	Q9NPB1	228 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-208	ENST00000579743	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	TPM1	P09493	284 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	MX2	P20592	715 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	UGT1A5	P35504	534 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	ETV3	P41162	512 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	GNPDA1	P46926	289 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	MAX	P61244	160 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	CFHR1	Q03591	330 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	MAP9	Q49MG5	647 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	PHF19	Q5T6S3	580 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	SEMA3C	Q99985	751 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	LGR4	Q9BXB1	951 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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