RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	TNF	P01375	233 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	TRBC1	P01850	177 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	PCCB	P05166	539 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	PDHA1	P08559	390 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	CTSE	P14091	401 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	ZNF30	P17039	623 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	FECH	P22830	423 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	LHCGR	P22888	699 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	GJC1	P36383	396 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	CLDN6	P56747	220 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	C1orf61	Q13536	156 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	NR0B2	Q15466	257 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	GKN2	Q86XP6	184 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	PAF1	Q8N7H5	531 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	IFI44	Q8TCB0	444 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	NUS1	Q96E22	293 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	WDR26	Q9H7D7	661 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	PADI4	Q9UM07	663 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137		A8MX80	341 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	TCEA3	O75764	348 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	HLA-DQB2	P05538	268 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	MMP2	P08253	660 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	MYF5	P13349	255 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	CA4	P22748	312 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	ETV3	P41162	512 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	MAGEA1	P43355	309 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	NR2C2	P49116	596 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	DSC2	Q02487	901 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	PTS	Q03393	145 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	PDK1	Q15118	436 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	SLC14A2	Q15849	920 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	KCTD16	Q68DU8	428 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	GUSBP11	Q6P575	273 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137		Q6ZVL8	140 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	PELI3	Q8N2H9	469 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	CNTD1	Q8N815	330 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	ARL10	Q8N8L6	244 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	PANX2	Q96RD6	677 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	LGMN	Q99538	433 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	LGR4	Q9BXB1	951 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	ABCG4	Q9H172	646 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	FGF22	Q9HCT0	170 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	LAMA5	O15230	3695 aa		11.47	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		11.47	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	APOL1	O14791	398 aa		11.47	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	PSTPIP1	O43586	416 aa		11.47	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	MAP3K6	O95382	1288 aa		11.47	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	JCHAIN	P01591	159 aa		11.47	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	CEACAM5	P06731	702 aa		11.47	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	PYGL	P06737	847 aa		11.47	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	COMT	P21964	271 aa		11.47	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	TGM2	P21980	687 aa		11.47	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	CDKN2B	P42772	138 aa		11.47	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	STC1	P52823	247 aa		11.47	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	ITK	Q08881	620 aa		11.47	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	ARHGEF7	Q14155	803 aa		11.47	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	CDKN3	Q16667	212 aa		11.47	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	ISX	Q2M1V0	245 aa		11.47	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		11.47	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	LRRC66	Q68CR7	880 aa		11.47	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		11.47	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		11.47	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	CCNY	Q8ND76	341 aa		11.47	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	GPR156	Q8NFN8	814 aa		11.47	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	MAPK15	Q8TD08	544 aa		11.47	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	TADA1	Q96BN2	335 aa		11.47	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	PDXP	Q96GD0	296 aa		11.47	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		11.47	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57

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