RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 FGF1P05230 155 aa17.01■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 CCL4P13236 92 aa17.01■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 UBXN1Q04323 297 aa17.01■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 IL10RBQ08334 325 aa17.01■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP17.01■□□□□ 0.312e-7■■■■□ 22.2
CS-214ENST00000548849 RFX8Q6ZV50 586 aa17.01■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa17.01■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 RCBTB1Q8NDN9 531 aa17.01■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa17.01■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 NSMCE3Q96MG7 304 aa17.01■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 GSDMCQ9BYG8 508 aa17.01■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 CHMP5Q9NZZ3 219 aa17.01■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 TERTO14746 1132 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 ECEL1O95672 775 aa17■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 CEACAM5P06731 702 aa17■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 AK4P27144 223 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 GNPDA1P46926 289 aa17■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 RENBPP51606 427 aa17■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 AP1S1P61966 158 aa17■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 LBRQ14739 615 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 HEATR4Q86WZ0 1026 aa17■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 NRROSQ86YC3 692 aa17■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 HTR3CQ8WXA8 447 aa17■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 COQ10AQ96MF6 247 aa17■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 SEMA3CQ99985 751 aa17■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 NUDT22Q9BRQ3 303 aa17■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 B3GNT4Q9C0J1 378 aa17■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 PARVAQ9NVD7 372 aa17■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 TAAR2Q9P1P5 351 aa17■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 SEPT3Q9UH03 358 aa17■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa17■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 GOLGA6CA6NDK9 693 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 GOLGA6BA6NDN3 693 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 TMCO5BA8MYB1 307 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 STMND1H3BQB6 276 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 SUV39H1O43463 412 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 PPFIA2O75334 1257 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 RNF8O76064 485 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 FUCA1P04066 466 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 CCDC172P0C7W6 258 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 GOLGA6DP0CG33 693 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 FERP16591 822 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 TNFAIP3P21580 790 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 SLC10A7Q0GE19 358 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 MAMLD1Q13495 774 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 CNGA3Q16281 694 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 SLC30A9Q6PML9 568 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 ZNF438Q7Z4V0 828 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 NPWQ8N729 165 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 CCDC74BQ96LY2 380 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 PSKH2Q96QS6 385 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 TAAR9Q96RI9 348 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 PEBP4Q96S96 227 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 TEX101Q9BY14 249 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 TAS2R14Q9NYV8 317 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 SUFUQ9UMX1 484 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 A0A1W2PQ67 120 aa16.98■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 LGALS16A8MUM7 142 aa16.98■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 HGSO14964 777 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 PRPSAP2O60256 369 aa16.98■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 NFKBIAP25963 317 aa16.98■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 CD1CP29017 333 aa16.98■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 VIPR1P32241 457 aa16.98■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 ETV3P41162 512 aa16.98■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 ATP1A2P50993 1020 aa16.98■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 ZNF235Q14590 738 aa16.98■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 NR1D2Q14995 579 aa16.98■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 CLCA4Q14CN2 919 aa16.98■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 TMCO4Q5TGY1 634 aa16.98■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 TP53INP2Q8IXH6 220 aa16.98■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa16.98■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 PATE1Q8WXA2 126 aa16.98■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 SLC25A18Q9H1K4 315 aa16.98■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 KCTD5Q9NXV2 234 aa16.98■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 BSNQ9UPA5 3926 aa16.98■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa16.98■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 CPP00450 1065 aa16.97■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms