RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 POLD2P49005 469 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 MMRN1Q13201 1228 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 INSCQ1MX18 579 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 Q3C1V9 767 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 KCNT1Q5JUK3 1230 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 SPAG16Q8N0X2 631 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 C1orf127Q8N9H9 656 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 ARL5BQ96KC2 179 aa6.07□□□□□ -1.44
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PTPRD-214ENST00000540109 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 KIFC1Q9BW19 673 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 KATNBL1Q9H079 304 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 PIF1Q9H611 641 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 CHST12Q9NRB3 414 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
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PTPRD-214ENST00000540109 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa6.07□□□□□ -1.44
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PTPRD-214ENST00000540109 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa6.07□□□□□ -1.44
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PTPRD-214ENST00000540109 ILDR2Q71H61 639 aa6.06□□□□□ -1.44
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PTPRD-214ENST00000540109 FAM172AQ8WUF8 416 aa6.06□□□□□ -1.44
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PTPRD-214ENST00000540109 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa6.06□□□□□ -1.44
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PTPRD-214ENST00000540109 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
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PTPRD-214ENST00000540109 Q96MT0 163 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 PAFAH2Q99487 392 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 TRMOQ9BU70 441 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 RMND5AQ9H871 391 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
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