RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534219.5

PTPRJ-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRJ, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-206ENST00000534219 ITPKBP27987 946 aa24.97■■□□□ 1.59
PTPRJ-206ENST00000534219 ETV3P41162 512 aa24.97■■□□□ 1.59
PTPRJ-206ENST00000534219 PTPRRQ15256 657 aa24.97■■□□□ 1.59
PTPRJ-206ENST00000534219 TBC1D25Q3MII6 688 aa24.97■■□□□ 1.59
PTPRJ-206ENST00000534219 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa24.97■■□□□ 1.59
PTPRJ-206ENST00000534219 TAF8Q7Z7C8 310 aa24.97■■□□□ 1.59
PTPRJ-206ENST00000534219 LSMEM2Q8N112 164 aa24.97■■□□□ 1.59
PTPRJ-206ENST00000534219 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
PTPRJ-206ENST00000534219 CHP1Q99653 195 aa24.97■■□□□ 1.59
PTPRJ-206ENST00000534219 CYP4F12Q9HCS2 524 aa24.97■■□□□ 1.59
PTPRJ-206ENST00000534219 SPTLC3Q9NUV7 552 aa24.97■■□□□ 1.59
PTPRJ-206ENST00000534219 HAUS2Q9NVX0 235 aa24.97■■□□□ 1.59
PTPRJ-206ENST00000534219 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP24.97■■□□□ 1.59
PTPRJ-206ENST00000534219 KCTD5Q9NXV2 234 aa24.97■■□□□ 1.59
PTPRJ-206ENST00000534219 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa24.97■■□□□ 1.59
PTPRJ-206ENST00000534219 KNTC1P50748 2209 aa24.96■■□□□ 1.59
PTPRJ-206ENST00000534219 TNFRSF10CO14798 259 aa24.96■■□□□ 1.59
PTPRJ-206ENST00000534219 PDHA1P08559 390 aa24.96■■□□□ 1.59
PTPRJ-206ENST00000534219 LHCGRP22888 699 aa24.96■■□□□ 1.59
PTPRJ-206ENST00000534219 CCNCP24863 283 aa24.96■■□□□ 1.59
PTPRJ-206ENST00000534219 MAN1A1P33908 653 aa24.96■■□□□ 1.59
PTPRJ-206ENST00000534219 EPHB1P54762 984 aa24.96■■□□□ 1.59
PTPRJ-206ENST00000534219 TSPAN33Q86UF1 283 aa24.96■■□□□ 1.59
PTPRJ-206ENST00000534219 CCNYQ8ND76 341 aa24.96■■□□□ 1.59
PTPRJ-206ENST00000534219 WDR48Q8TAF3 677 aa24.96■■□□□ 1.59
PTPRJ-206ENST00000534219 SLC35G2Q8TBE7 412 aa24.96■■□□□ 1.59
PTPRJ-206ENST00000534219 LRRN4Q8WUT4 740 aa24.96■■□□□ 1.59
PTPRJ-206ENST00000534219 MAML1Q92585 1016 aa24.96■■□□□ 1.59
PTPRJ-206ENST00000534219 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa24.96■■□□□ 1.59
PTPRJ-206ENST00000534219 CRELD1Q96HD1 420 aa24.96■■□□□ 1.59
PTPRJ-206ENST00000534219 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
PTPRJ-206ENST00000534219 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
PTPRJ-206ENST00000534219 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa24.96■■□□□ 1.59
PTPRJ-206ENST00000534219 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
PTPRJ-206ENST00000534219 CASC3O15234 703 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 TCEA3O75764 348 aa24.95■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 MX2P20592 715 aa24.95■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 LSSP48449 732 aa24.95■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 DSC2Q02487 901 aa24.95■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 GBE1Q04446 702 aa24.95■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 SPIDRQ14159 915 aa24.95■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 C3orf38Q5JPI3 329 aa24.95■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 HEATR4Q86WZ0 1026 aa24.95■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 PQLC3Q8N755 202 aa24.95■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 FAM46DQ8NEK8 389 aa24.95■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 PIH1D2Q8WWB5 315 aa24.95■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 RAPGEF5Q92565 580 aa24.95■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 CCDC74AQ96AQ1 378 aa24.95■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 DTD2Q96FN9 168 aa24.95■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 TSGA13Q96PP4 275 aa24.95■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 TMEM168Q9H0V1 697 aa24.95■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 PSMD11O00231 422 aa24.94■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 MFAP3LO75121 409 aa24.94■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 CCNB1P14635 433 aa24.94■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 CES1P23141 567 aa24.94■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 KDELR1P24390 212 aa24.94■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 CCDC173Q0VFZ6 552 aa24.94■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 RAET1GQ6H3X3 334 aa24.94■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 Q6ZVL8 140 aa24.94■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 GRAMD1AQ96CP6 724 aa24.94■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 FAF2Q96CS3 445 aa24.94■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 SATB2Q9UPW6 733 aa24.94■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa24.94■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 URB1O60287 2271 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 ADAMTS20P59510 1910 aa24.94■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 A0A0U1RQS6 177 aa24.93■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 PRSS38A1L453 326 aa24.93■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 LRRD1A4D1F6 860 aa24.93■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 FOXR1Q6PIV2 292 aa24.93■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 OR6C4Q8NGE1 309 aa24.93■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 RNF157Q96PX1 679 aa24.93■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 TEX101Q9BY14 249 aa24.93■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 DPEP2Q9H4A9 486 aa24.93■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 AMACRQ9UHK6 382 aa24.93■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 CD84Q9UIB8 345 aa24.93■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 CHKBQ9Y259 395 aa24.93■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 PPIL1Q9Y3C6 166 aa24.93■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 FZD6O60353 706 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 CA4P22748 312 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 ARHGAP25P42331 645 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 ODF2Q5BJF6 829 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 LRRC66Q68CR7 880 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 RHOT2Q8IXI1 618 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 CCDC13Q8IYE1 715 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 GPR156Q8NFN8 814 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 CCL4L1Q8NHW4 92 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 FATE1Q969F0 183 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 SMIM14Q96QK8 99 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRJ-206ENST00000534219 LGMNQ99538 433 aa24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 190.1 ms