RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526116.5

EML3-215, Transcript of echinoderm microtubule associated protein like 3, human

TSL 3

Gene EML3, Length 581 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EML3-215	ENST00000526116	PRL	P01236	227 aa		21.3	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	JCHAIN	P01591	159 aa		21.3	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	TRBC1	P01850	177 aa		21.3	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	ALPI	P09923	528 aa		21.3	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	KRT10	P13645	584 aa		21.3	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	TNNT1	P13805	278 aa		21.3	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	21.3	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	21.3	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	ZBTB17	Q13105	803 aa		21.3	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	C1orf61	Q13536	156 aa		21.3	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	PTPRR	Q15256	657 aa		21.3	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	ELOC	Q15369	112 aa		21.3	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	ODF2	Q5BJF6	829 aa		21.3	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		21.3	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	NPNT	Q6UXI9	565 aa		21.3	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		21.3	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		21.3	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		21.3	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	RFX6	Q8HWS3	928 aa		21.3	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	HID1	Q8IV36	788 aa		21.3	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		21.3	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		21.3	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	CNTD1	Q8N815	330 aa		21.3	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	WDR26	Q9H7D7	661 aa		21.3	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	KL	Q9UEF7	1012 aa		21.3	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	RP1	P56715	2156 aa		21.3	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	TMEM202	A6NGA9	273 aa		21.29	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	21.29	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	21.29	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	YY2	O15391	372 aa		21.29	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	MMP2	P08253	660 aa		21.29	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	MYF5	P13349	255 aa		21.29	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	JUP	P14923	745 aa		21.29	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	CTPS1	P17812	591 aa		21.29	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	CA4	P22748	312 aa		21.29	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	ETV3	P41162	512 aa		21.29	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	21.29	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	ARHGEF7	Q14155	803 aa		21.29	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	KCTD16	Q68DU8	428 aa		21.29	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	PROSER1	Q86XN7	944 aa		21.29	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		21.29	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	21.29	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	21.29	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		21.29	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	PDXP	Q96GD0	296 aa		21.29	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	LGR4	Q9BXB1	951 aa		21.29	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		21.29	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	FGF22	Q9HCT0	170 aa		21.29	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	21.29	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	ITPR1	Q14643	2758 aa		21.28	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	RCCD1	A6NED2	376 aa		21.28	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		21.28	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	CAPN8	A6NHC0	703 aa		21.28	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	TNFRSF10C	O14798	259 aa		21.28	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	ANXA6	P08133	673 aa		21.28	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	21.28	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	ZNF30	P17039	623 aa		21.28	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	KEL	P23276	732 aa		21.28	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	TEAD1	P28347	426 aa		21.28	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	NR2C2	P49116	596 aa		21.28	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	DYNLT1	P63172	113 aa		21.28	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	AP1B1	Q10567	949 aa		21.28	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	LRRC66	Q68CR7	880 aa		21.28	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	DENND2C	Q68D51	928 aa		21.28	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		21.28	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		21.28	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		21.28	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116		Q6ZVL8	140 aa		21.28	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		21.28	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		21.28	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		21.28	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	SMIM14	Q96QK8	99 aa		21.28	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	LYSMD1	Q96S90	227 aa		21.28	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	21.28	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	TEX101	Q9BY14	249 aa		21.28	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	21.28	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		21.28	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		21.28	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	CHKB	Q9Y259	395 aa		21.28	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	21.27	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	TAF4	O00268	1085 aa		21.27	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	KRT37	O76014	449 aa		21.27	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	21.27	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	CTSE	P14091	401 aa		21.27	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	MARCKSL1	P49006	195 aa		21.27	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	EPHB1	P54762	984 aa		21.27	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	SKOR1	P84550	965 aa		21.27	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	PTS	Q03393	145 aa		21.27	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	DPT	Q07507	201 aa		21.27	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	21.27	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	TFDP2	Q14188	446 aa		21.27	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		21.27	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		21.27	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		21.27	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	MDM1	Q8TC05	714 aa		21.27	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	IFI44	Q8TCB0	444 aa		21.27	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	21.27	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		21.27	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	21.27	■■□□□ 1
EML3-215	ENST00000526116		A0A0U1RQS6	177 aa		21.26	■□□□□ 0.99

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