RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524131.5

MEG3-223, Transcript of maternally expressed 3, human

TSL 5 BASIC

Gene MEG3, Length 721 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEG3-223	ENST00000524131	MTBP	Q96DY7	904 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	AGAP3	Q96P47	875 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	PAFAH2	Q99487	392 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	GFRA2	O00451	464 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	11.74	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	BANF1	O75531	89 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	KRT38	O76015	456 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	CNTN5	O94779	1100 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	DKK1	O94907	266 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	PEX11B	O96011	259 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	MAOB	P27338	520 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	ATP1A2	P50993	1020 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	OXCT1	P55809	520 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	TMED2	Q15363	201 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	ALF	Q53S48	1182 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	11.74	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	CPXM2	Q8N436	756 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	FOXJ1	Q92949	421 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	HMCES	Q96FZ2	354 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	CFAP36	Q96G28	342 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	SGSM3	Q96HU1	749 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	BBS2	Q9BXC9	721 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	11.74	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	WASH3P	C4AMC7	463 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	NDUFS2	O75306	463 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	AVIL	O75366	819 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	USP1	O94782	785 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	C1QA	P02745	245 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	HLA-DQB2	P05538	268 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	CISD3	P0C7P0	127 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	ZNF883	P0CG24	379 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	BRAF	P15056	766 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	KRT15	P19012	456 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	CD6	P30203	668 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	SLC6A4	P31645	630 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	LSP1	P33241	339 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	DGKG	P49619	791 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	BNC1	Q01954	994 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	GNA12	Q03113	381 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	MGAT5	Q09328	741 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	LAMB3	Q13751	1172 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	ENPP2	Q13822	863 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	FUT11	Q495W5	492 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	MPP7	Q5T2T1	576 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131		Q6ZNB5	142 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	TMEM135	Q86UB9	458 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	DENND1C	Q8IV53	801 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	SMC6	Q96SB8	1091 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	CEP41	Q9BYV8	373 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	EPN3	Q9H201	632 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	TRABD	Q9H4I3	376 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	IL21R	Q9HBE5	538 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		11.73	□□□□□ -0.53

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