RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	IQUB	Q8NA54	791 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	TEKT4	Q8WW24	435 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	MR1	Q95460	341 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	GPR78	Q96P69	363 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	BBS4	Q96RK4	519 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	THAP9	Q9H5L6	903 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	SETD4	Q9NVD3	440 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	HPF1	Q9NWY4	346 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	FZD4	Q9ULV1	537 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF521	Q96K83	1311 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	CUX2	O14529	1486 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	PRX	Q9BXM0	1461 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	TOPBP1	Q92547	1522 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	KRT87P	A6NCN2	255 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	OR6C68	A6NDL8	312 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	OR6C76	A6NM76	312 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	USP17L23	D6RBM5	183 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	SCAMP1	O15126	338 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	ZBTB14	O43829	449 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	USP12	O75317	370 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC22A3	O75751	556 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC2A4	P14672	509 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	IGFBP2	P18065	325 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	NDUFS1	P28331	727 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	DUSP1	P28562	367 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	CCR3	P51677	355 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	BMX	P51813	675 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	CAPZA1	P52907	286 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	CYP4F2	P78329	520 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	CYP4A11	Q02928	519 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	CFHR3	Q02985	330 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	RALGDS	Q12967	914 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	GRAP	Q13588	217 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	FGFBP1	Q14512	234 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	CNGA3	Q16281	694 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	C5orf22	Q49AR2	442 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	CEP162	Q5TB80	1403 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	ADCK2	Q7Z695	626 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	AACS	Q86V21	672 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	IQCH	Q86VS3	1027 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	MMP21	Q8N119	569 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	TC2N	Q8N9U0	490 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	WASF1	Q92558	559 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	TAF4B	Q92750	862 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	AK8	Q96MA6	479 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM237	Q96Q45	408 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	MMS19	Q96T76	1030 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	MGME1	Q9BQP7	344 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	ASIC5	Q9NY37	505 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	PLK2	Q9NYY3	685 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	PKP3	Q9Y446	797 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		4.07	□□□□□ -1.76
FAM49B-222	ENST00000522702	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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