RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519254.2

CLN8-204, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-204ENST00000519254 GKP32189 559 aa14.52□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 ARSDP51689 593 aa14.52□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 ST8SIA6P61647 398 aa14.52□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 CES4AQ5XG92 561 aa14.52□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 ZNF470Q6ECI4 717 aa14.52□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 CLEC14AQ86T13 490 aa14.52□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 CCDC63Q8NA47 563 aa14.52□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 OR2AP1Q8NGE2 309 aa14.52□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 FAM167BQ9BTA0 163 aa14.52□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 MTG2Q9H4K7 406 aa14.52□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa14.52□□□□□ -0.09
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CLN8-204ENST00000519254 FBXO5Q9UKT4 447 aa14.52□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa14.52□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 PIAS3Q9Y6X2 628 aa14.52□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 UNC80Q8N2C7 3258 aa14.52□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa14.51□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 ANTXRLA6NF34 631 aa14.51□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 CCT8L1PA6NM43 557 aa14.51□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa14.51□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 KLF11O14901 512 aa14.51□□□□□ -0.09
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CLN8-204ENST00000519254 BPGMP07738 259 aa14.51□□□□□ -0.09
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CLN8-204ENST00000519254 CTHP32929 405 aa14.51□□□□□ -0.09
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CLN8-204ENST00000519254 GRIA2P42262 883 aa14.51□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 GALK1P51570 392 aa14.51□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 ACVR1Q04771 509 aa14.51□□□□□ -0.09
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CLN8-204ENST00000519254 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 UGP2Q16851 508 aa14.51□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 NCEH1Q6PIU2 408 aa14.51□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 PAF1Q8N7H5 531 aa14.51□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 BRSK1Q8TDC3 778 aa14.51□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa14.51□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 CCT6BQ92526 530 aa14.51□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 P2RY13Q9BPV8 354 aa14.51□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 CEP44Q9C0F1 390 aa14.51□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 ZNF358Q9NW07 568 aa14.51□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 TMEM216Q9P0N5 145 aa14.51□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 SLC39A10Q9ULF5 831 aa14.51□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 SLC8A2Q9UPR5 921 aa14.51□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa14.51□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 ARL5AQ9Y689 179 aa14.51□□□□□ -0.09
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CLN8-204ENST00000519254 SLC7A4O43246 635 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 PIGNO95427 931 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 PROCP04070 461 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 C2P06681 752 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 PDHA1P08559 390 aa14.5□□□□□ -0.09
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CLN8-204ENST00000519254 IRF9Q00978 393 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 TRAF2Q12933 501 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 PTPRCAPQ14761 206 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 TXNDC11Q6PKC3 985 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 NUDCD3Q8IVD9 361 aa14.5□□□□□ -0.09
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CLN8-204ENST00000519254 HDAC10Q969S8 669 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
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CLN8-204ENST00000519254 MFSD1Q9H3U5 465 aa14.5□□□□□ -0.09
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CLN8-204ENST00000519254 AURKAO14965 403 aa14.5□□□□□ -0.09
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CLN8-204ENST00000519254 POLD2P49005 469 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 PGGT1BP53609 377 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 SEC13P55735 322 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 IRX4P78413 519 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 LAMB3Q13751 1172 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 PON2Q15165 354 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN8-204ENST00000519254 CARD16Q5EG05 197 aa14.5□□□□□ -0.09
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