RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516577.1

RNU6-1018P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1018, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1018P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PCDH9Q9HC56 1237 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PNPLA8Q9NP80 782 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SIX2Q9NPC8 291 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CNGB3Q9NQW8 809 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HELLSQ9NRZ9 838 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC52A1Q9NWF4 448 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MCM9Q9NXL9 1143 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ANAPC11Q9NYG5 84 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LRWD1Q9UFC0 647 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NDRG3Q9UGV2 375 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KCNJ14Q9UNX9 436 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 UMODL1Q5DID0 1318 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 STK36Q9NRP7 1315 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ATRXP46100 2492 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 A0A1W2PPC4 97 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PLOD2O00469 737 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PIP5K1BO14986 540 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SYNGR3O43761 229 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NADKO95544 446 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NGFP01138 241 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CYP4B1P13584 511 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IDEP14735 1019 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CHATP28329 748 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CENPAP49450 140 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RPP30P78346 268 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PDE1BQ01064 536 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GALEQ14376 348 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IL13RA2Q14627 380 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CTF1Q16619 201 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ESCO2Q56NI9 601 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NCAPH2Q6IBW4 605 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OR7E24Q6IFN5 339 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IL27RAQ6UWB1 636 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC36A4Q6YBV0 504 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TMEM64Q6YI46 380 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 Q6ZSR9 355 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GALNT7Q86SF2 657 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TXLNBQ8N3L3 684 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SETD9Q8NE22 299 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 C18orf8Q96DM3 657 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZIM3Q96PE6 472 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LRRC61Q9BV99 259 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 BTBD1Q9H0C5 482 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RAD21L1Q9H4I0 556 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FKRPQ9H9S5 495 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HOMER2Q9NSB8 354 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 C1orf112Q9NSG2 853 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZIM2Q9NZV7 527 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 POMT2Q9UKY4 750 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DHDHQ9UQ10 334 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FLT1P17948 1338 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ITGB4P16144 1822 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 C1orf226A1L170 272 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 C5orf60A6NFR6 353 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MAGEB17A8MXT2 336 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 EPM2AB3EWF7 344 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 APOL1O14791 398 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNHIT1O43257 154 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZBED1O96006 694 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NR3C1P04150 777 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CYC1P08574 325 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MELTFP08582 738 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ACP5P13686 325 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF32P17041 273 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KLK2P20151 261 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 BCL3P20749 454 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HNF4AP41235 474 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PCP4P48539 62 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ARSFP54793 590 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MS4A2Q01362 244 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GRM3Q14832 879 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ARHGEF6Q15052 776 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 C2CD6Q53TS8 623 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SH2D4BQ5SQS7 431 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TRNP1Q6NT89 227 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 BEND5Q7L4P6 421 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RTN4RL2Q86UN3 420 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NOXA1Q86UR1 476 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TMTC1Q8IUR5 882 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FAM186BQ8IYM0 893 aa0.56□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms