RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516206.1

RNU6-904P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 904, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-904P, Length 101 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-904P-201ENST00000516206 KRTAP12-3P60328 96 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 SLC5A9Q2M3M2 681 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 PLEKHG6Q3KR16 790 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 XKR3Q5GH77 459 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 OR7E24Q6IFN5 339 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 IL27RAQ6UWB1 636 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 ADCK1Q86TW2 530 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 TMTC1Q8IUR5 882 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 RASGRP3Q8IV61 690 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 SCAIQ8N9R8 606 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 MAGEC3Q8TD91 643 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZFAND2BQ8WV99 257 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 KCNJ9Q92806 393 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 MPHOSPH8Q99549 860 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 CNGB3Q9NQW8 809 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 UPB1Q9UBR1 384 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 AGAP5A6NIR3 686 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 MAGEB17A8MXT2 336 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 KPNA7A9QM74 516 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 F8W8V4 182 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZNHIT1O43257 154 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 GPRIN2O60269 458 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 NADKO95544 446 aaPredicted RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 C22orf31O95567 290 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 PROS1P07225 676 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 PF4V1P10720 104 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 PDE1BQ01064 536 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZNF234Q14588 700 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 SHHQ15465 462 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 GXYLT1Q4G148 440 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 EIPR1Q53HC9 387 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 ARHGEF16Q5VV41 709 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 RAD9BQ6WBX8 426 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 OVCH2Q7RTZ1 564 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 TRABD2AQ86V40 505 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 SLC47A2Q86VL8 602 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 CCDC150Q8NCX0 1101 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 IQCDQ96DY2 449 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 APIPQ96GX9 242 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 SERAC1Q96JX3 654 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 LRGUKQ96M69 825 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 TEX13BQ9BXU2 312 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 MAGEB5Q9BZ81 275 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 PDFQ9HBH1 243 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 GRHL1Q9NZI5 618 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 DHDHQ9UQ10 334 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 FAM205AQ6ZU69 1335 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 HCFC1P51610 2035 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 A0A1W2PP11 408 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 NPIPB13A6NJU9 1138 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 KIF28PB7ZC32 967 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 GRM8O00222 908 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 SYN3O14994 580 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 SLC22A2O15244 555 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 ATP2C2O75185 946 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 RPP40O75818 363 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 LY6G6DO95868 133 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 IL1AP01583 271 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 RAF1P04049 648 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 FDPSP14324 419 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 PIK3R1P27986 724 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 WNT5AP41221 380 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 HALP42357 657 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 AMPHP49418 695 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 RCAN1P53805 252 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 HUNKP57058 714 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 SLC18A2Q05940 514 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 GRM4Q14833 912 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZNF79Q15937 498 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZNF569Q5MCW4 686 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 AADACL2Q6P093 401 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 SLC36A4Q6YBV0 504 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 CEACAM19Q7Z692 300 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 IQCHQ86VS3 1027 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 FOXRED2Q8IWF2 684 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 CD177Q8N6Q3 437 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 SUMF1Q8NBK3 374 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 PRSS33Q8NF86 280 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 MIPOL1Q8TD10 442 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 RSC1A1Q92681 617 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 SEMA4DQ92854 862 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 MAGED4Q96JG8 741 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 MSLNLQ96KJ4 702 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 PCYT2Q99447 389 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-904P-201ENST00000516206 CMKLR1Q99788 373 aa0.37□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms