RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 ARHGEF7Q14155 803 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 LY6DQ14210 128 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP16.94■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 DENND2CQ68D51 928 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 TMCO3Q6UWJ1 677 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 JAMLQ86YT9 394 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 NUS1Q96E22 293 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 CSPG4P5Q96PW8 444 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 NUDCD1Q96RS6 583 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 SEMA4CQ9C0C4 833 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 ISCUQ9H1K1 167 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 NOD2Q9HC29 1040 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP16.94■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 LRIT1Q9P2V4 623 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 A0A1W2PQ67 120 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 PRSS38A1L453 326 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 MAFKO60675 156 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 SOCS5O75159 536 aa16.93■□□□□ 0.3
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HERC3-211ENST00000513325 JMJD7P0C870 316 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 RARAP10276 462 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 PNLIPP16233 465 aa16.93■□□□□ 0.3
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HERC3-211ENST00000513325 MAXP61244 160 aa16.93■□□□□ 0.3
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HERC3-211ENST00000513325 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 SPRED1Q7Z699 444 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 MGME1Q9BQP7 344 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
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HERC3-211ENST00000513325 PISDQ9UG56 409 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 PHTF1Q9UMS5 762 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 LOXL2Q9Y4K0 774 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 KALRNO60229 2985 aa16.92■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 CAPN8A6NHC0 703 aa16.92■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
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HERC3-211ENST00000513325 ETV3P41162 512 aa16.92■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 ZNF165P49910 485 aa16.92■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
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HERC3-211ENST00000513325 NR1I3Q14994 352 aa16.92■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 PTPRRQ15256 657 aa16.92■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 TGIF1Q15583 401 aa16.92■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa16.92■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 HEATR4Q86WZ0 1026 aa16.92■□□□□ 0.3
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HERC3-211ENST00000513325 BBS5Q8N3I7 341 aa16.92■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 ATPAF2Q8N5M1 289 aa16.92■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 DTD2Q96FN9 168 aa16.92■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 TEX101Q9BY14 249 aa16.92■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 EFSO43281 561 aa16.91■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 CEACAM5P06731 702 aa16.91■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 CCNB1P14635 433 aa16.91■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 ITIH1P19827 911 aa16.91■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 LHCGRP22888 699 aa16.91■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 NFKBIAP25963 317 aa16.91■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 MMP13P45452 471 aa16.91■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 CDK3Q00526 305 aa16.91■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 B4GALNT1Q00973 533 aa16.91■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 MARC1Q5VT66 337 aa16.91■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 HGSNATQ68CP4 663 aa16.91■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 Q6ZVL8 140 aa16.91■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa16.91■□□□□ 0.3
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HERC3-211ENST00000513325 KIAA1524Q8TCG1 905 aa16.91■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 GPBAR1Q8TDU6 330 aa16.91■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 NSMCE1Q8WV22 266 aa16.91■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
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HERC3-211ENST00000513325 GSDMCQ9BYG8 508 aa16.91■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 PCDH18Q9HCL0 1135 aa16.91■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 KCTD5Q9NXV2 234 aa16.91■□□□□ 0.3
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HERC3-211ENST00000513325 GOLGA6BA6NDN3 693 aa16.9■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 B4GAT1O43505 415 aa16.9■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 PGLSO95336 258 aa16.9■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 SERPINC1P01008 464 aa16.9■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 FGF1P05230 155 aa16.9■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 GOLGA6DP0CG33 693 aa16.9■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 CTPS1P17812 591 aa16.9■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 AK4P27144 223 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 SERPINB6P35237 376 aa16.9■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 GNPDA1P46926 289 aa16.9■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 POLD2P49005 469 aa16.9■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 CDH6P55285 790 aa16.9■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 MAZP56270 477 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP16.9■□□□□ 0.3
HERC3-211ENST00000513325 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
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