RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510628.1

SMIM14-204, Transcript of small integral membrane protein 14, human

TSL 3

Gene SMIM14, Length 634 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMIM14-204	ENST00000510628	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628		A0A1W2PQF6	199 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	TMEM202	A6NGA9	273 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	WNT9B	O14905	357 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	HSPA12A	O43301	675 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	CD58	P19256	250 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	ARL3	P36405	182 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	AMT	P48728	403 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	PCYT1A	P49585	367 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	MXI1	P50539	228 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	DSC1	Q08554	894 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	NAE1	Q13564	534 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	MED22	Q15528	200 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	USP41	Q3LFD5	358 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	TTI2	Q6NXR4	508 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	MTSS1L	Q765P7	747 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	WDR63	Q8IWG1	891 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	PDILT	Q8N807	584 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	FRMD1	Q8N878	549 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	USP6NL	Q92738	828 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	LRFN5	Q96NI6	719 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	EHD2	Q9NZN4	543 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	ABI3	Q9P2A4	366 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	MYO6	Q9UM54	1294 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMIM14-204	ENST00000510628	FMN1	Q68DA7	1419 aa		3.34	□□□□□ -1.88
SMIM14-204	ENST00000510628	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88
SMIM14-204	ENST00000510628	MAP3K1	Q13233	1512 aa		3.34	□□□□□ -1.88
SMIM14-204	ENST00000510628	NES	P48681	1621 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SMIM14-204	ENST00000510628	NOTCH4	Q99466	2003 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SMIM14-204	ENST00000510628	DYTN	A2CJ06	578 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SMIM14-204	ENST00000510628	LIPT2	A6NK58	231 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SMIM14-204	ENST00000510628	ZIC3	O60481	467 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SMIM14-204	ENST00000510628	ZBED4	O75132	1171 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SMIM14-204	ENST00000510628	PTP4A3	O75365	173 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SMIM14-204	ENST00000510628	TIPRL	O75663	272 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SMIM14-204	ENST00000510628	MLYCD	O95822	493 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SMIM14-204	ENST00000510628	SCGB1D1	O95968	90 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SMIM14-204	ENST00000510628	GLUD1	P00367	558 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SMIM14-204	ENST00000510628	ALPL	P05186	524 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SMIM14-204	ENST00000510628	ACADM	P11310	421 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SMIM14-204	ENST00000510628	RARG	P13631	454 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SMIM14-204	ENST00000510628	IL7R	P16871	459 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SMIM14-204	ENST00000510628	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
SMIM14-204	ENST00000510628	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
SMIM14-204	ENST00000510628	GLUD2	P49448	558 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SMIM14-204	ENST00000510628	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
SMIM14-204	ENST00000510628	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
SMIM14-204	ENST00000510628	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
SMIM14-204	ENST00000510628	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SMIM14-204	ENST00000510628	TRAF2	Q12933	501 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SMIM14-204	ENST00000510628	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
SMIM14-204	ENST00000510628	KRT24	Q2M2I5	525 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SMIM14-204	ENST00000510628	MMEL1	Q495T6	779 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SMIM14-204	ENST00000510628	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
SMIM14-204	ENST00000510628	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SMIM14-204	ENST00000510628	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
SMIM14-204	ENST00000510628	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SMIM14-204	ENST00000510628	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SMIM14-204	ENST00000510628	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SMIM14-204	ENST00000510628	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SMIM14-204	ENST00000510628	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SMIM14-204	ENST00000510628	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		3.33	□□□□□ -1.88

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms